RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 MCF2P10911 925 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 ACTN1P12814 892 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 FGFR4P22455 802 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 TNFSF9P41273 254 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT7BP56706 349 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 SNX17Q15036 470 aa27.01■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 TRIM65Q6PJ69 517 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 RPAINQ86UA6 219 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 BRSK2Q8IWQ3 736 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 BAP1Q92560 729 aa27.01■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.01■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 LMO3Q8TAP4 145 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 FBXL5Q9UKA1 691 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 KRT39Q6A163 491 aa27■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa26.99■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF516Q92618 1163 aa26.99■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PQY0 241 aa26.98■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 CEP350Q5VT06 3117 aa26.95■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 PTK7Q13308 1070 aa26.95■■□□□ 1.91
CAPNS1-215ENST00000628018 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 CYP26C1Q6V0L0 522 aa26.95■■□□□ 1.91
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZACNQ401N2 412 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM192Q8IY95 271 aa26.95■■□□□ 1.9
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CAPNS1-215ENST00000628018 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.95■■□□□ 1.9
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
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