RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-211ENST00000626236 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.29□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 TRIP11Q15643 1979 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 ENPP3O14638 875 aa9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
SGMS1-211ENST00000626236 CETN3O15182 167 aa9.28□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 SKIP12755 728 aa9.28□□□□□ -0.92
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SGMS1-211ENST00000626236 SMTNL1A8MU46 457 aa9.27□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 LRRC55Q6ZSA7 311 aa9.27□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
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SGMS1-211ENST00000626236 LRFN2Q9ULH4 789 aa9.27□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa9.27□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF233A6NK53 670 aa9.26□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 MEIS3P2A8K0S8 358 aa9.26□□□□□ -0.93
SGMS1-211ENST00000626236 H0YGN5 161 aa9.26□□□□□ -0.93
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