RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	EPC1	Q9H2F5	836 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CORO1C	Q9ULV4	474 aa	Predicted RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	NRCAM	Q92823	1304 aa		7.83	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087X0B3	334 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	DENND3	A2RUS2	1198 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC16A4	O15374	487 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PLA2G4B	P0C869	781 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	FER	P16591	822 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RARRES1	P49788	294 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	GHRHR	Q02643	423 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SHH	Q15465	462 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP57	Q86XR8	500 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	C4orf32	Q8N8J7	132 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ENO4	A6NNW6	628 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	COL6A1	P12109	1028 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	IRAK1	P51617	712 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFA8	P51970	172 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PPP2R5C	Q13362	524 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PTPA	Q15257	358 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	HSP90AA4P	Q58FG1	418 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ODR4	Q5SWX8	454 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	MARCH8	Q5T0T0	291 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ARMC3	Q5W041	872 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SHC4	Q6S5L8	630 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC73	Q6ZRK6	1079 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RDH13	Q8NBN7	331 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	C17orf50	Q8WW18	174 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	NACC1	Q96RE7	527 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	GGA2	Q9UJY4	613 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM13A	O94988	1023 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	MYL1	P05976	194 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SYK	P43405	635 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RANBP1	P43487	201 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TMED1	Q13445	227 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	BFSP2	Q13515	415 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	STX1A	Q16623	288 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PARP9	Q8IXQ6	854 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM199	Q8N511	208 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM58	Q8NG06	486 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	LPP	Q93052	612 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	AGAP3	Q96P47	875 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	MTR	Q99707	1265 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM7	Q9C029	511 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	KLK14	Q9P0G3	267 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495		Q9Y3F1	56 aa		7.82	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	BECN2	A8MW95	431 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	B4GALT5	O43286	388 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	HIP1R	O75146	1068 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PFKFB1	P16118	471 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	RPA1	P27694	616 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	FPGS	Q05932	587 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAG1	Q07617	926 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC38	Q502W7	563 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	IER5	Q5VY09	327 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRED2	Q7Z698	418 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SRGAP1	Q7Z6B7	1085 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	SESTD1	Q86VW0	696 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC15	Q8TF66	581 aa		7.81	□□□□□ -1.16
LETMD1-238	ENST00000623495	LRCH3	Q96II8	777 aa		7.81	□□□□□ -1.16

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