RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623028.1

VGLL4-218, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene VGLL4, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-218ENST00000623028 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 RPS6KC1Q96S38 1066 aa20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 KANSL3Q9P2N6 904 aa20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 PCDHA7Q9UN72 937 aa20.63■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ME1P48163 572 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 GRIK3Q13003 919 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 STRN3Q13033 797 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 E2F4Q16254 413 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CTC1Q2NKJ3 1217 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TMC7Q7Z402 723 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 VPS52Q8N1B4 723 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 DHX58Q96C10 678 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 DNAJC19Q96DA6 116 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TMEM175Q9BSA9 504 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ZBP1Q9H171 429 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CUL9Q8IWT3 2517 aa20.62■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 PLXNA3P51805 1871 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TRAK2O60296 914 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 BMP1P13497 986 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 BECN1Q14457 450 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 SV2BQ7L1I2 683 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TCHPQ9BT92 498 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TLE6Q9H808 572 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TISP43B9A030 160 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 GRM5P41594 1212 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ADAM15Q13444 863 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 NAB2Q15742 525 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 DUSP6Q16828 381 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 FAM178BQ8IXR5 827 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 HASPINQ8TF76 798 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 BICD1Q96G01 975 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 RCOR1Q9UKL0 485 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TBX20Q9UMR3 447 aa20.6■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 C5orf42Q9H799 3197 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 VWA8A3KMH1 1905 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TTC28Q96AY4 2481 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ANK1P16157 1881 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 C2orf71A6NGG8 1288 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 DLL1O00548 723 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ALDH2P05091 517 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 MCF2P10911 925 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 NDUFV1P49821 464 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TMEM130Q8N3G9 435 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 EFHBQ8N7U6 833 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 B3GALT6Q96L58 329 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CFAP45Q9UL16 551 aa20.59■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TOM1L1O75674 476 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 IDEP14735 1019 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 IL9P15248 144 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CASP1P29466 404 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CASP5P51878 434 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 AAK1Q2M2I8 961 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 LEXMQ3ZCV2 418 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 RESP18Q5W5W9 173 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ATL3Q6DD88 541 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ZPBP2Q6X784 338 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 PPP2R3CQ969Q6 453 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 CLEC1BQ9P126 229 aa20.58■□□□□ 0.89
VGLL4-218ENST00000623028 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 KIF4AO95239 1232 aa20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 CXCL14O95715 111 aa20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 THP07101 528 aa20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 CTSAP10619 480 aa20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 LIG4P49917 911 aa20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 TUSC3Q13454 348 aa20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 PTPN14Q15678 1187 aa20.57■□□□□ 0.88
VGLL4-218ENST00000623028 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms