RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622171.1

LINC00649-219, long intergenic non-protein coding RNA 649, human

TSL 5

Gene LINC00649, Length 207 nt, Biotype antisense RNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00649-219	ENST00000622171	CCL16	O15467	120 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	TEX28	O15482	410 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	EYA4	O95677	639 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	EOMES	O95936	686 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PLA2G4B	P0C869	781 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	CXCL8	P10145	99 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	SYT1	P21579	422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	NMT1	P30419	496 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PPM1A	P35813	382 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PLCB3	Q01970	1234 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	KRT17	Q04695	432 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	MAPK6	Q16659	721 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	FUT10	Q6P4F1	479 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	GET4	Q7L5D6	327 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	STKLD1	Q8NE28	680 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	RSAD2	Q8WXG1	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	ING5	Q8WYH8	240 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PPP2R3C	Q969Q6	453 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	USP28	Q96RU2	1077 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	TCHP	Q9BT92	498 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	HERC2P3	Q9BVR0	1158 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	POLI	Q9UNA4	740 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	MYOF	Q9NZM1	2061 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LINC00649-219	ENST00000622171		A0A1B0GUA9	196 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171		K7ERI5	159 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	ACKR2	O00590	384 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	N4BP3	O15049	544 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	INPPL1	O15357	1258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	ASAP2	O43150	1006 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	DCX	O43602	365 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	ZNF623	O75123	536 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	TADA2A	O75478	443 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	FAM13A	O94988	1023 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	SOD2	P04179	222 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	OR4Q2	P0C623	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	CTSA	P10619	480 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	DDIT3	P35638	169 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	UBA7	P41226	1012 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	NAMPT	P43490	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	GLUD2	P49448	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	CLCN4	P51793	760 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	CLCNKB	P51801	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	SLC12A3	P55017	1021 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	WNT7B	P56706	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	UBE3A	Q05086	875 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	DSC1	Q08554	894 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	KCNA1	Q09470	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	GRIK3	Q13003	919 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	COASY	Q13057	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	CUL4A	Q13619	759 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	COL19A1	Q14993	1142 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	NAB2	Q15742	525 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LINC00649-219	ENST00000622171	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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