RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616600.4

HDGFL2-208, Transcript of HDGF like 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL2, Length 2,281 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL2-208ENST00000616600 PEX26Q7Z412 305 aa21.96■■□□□ 1.11
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HDGFL2-208ENST00000616600 SCFD2Q8WU76 684 aa21.96■■□□□ 1.11
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HDGFL2-208ENST00000616600 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HDGFL2-208ENST00000616600 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.18e-7■■■□□ 18.6
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HDGFL2-208ENST00000616600 USP20Q9Y2K6 914 aa21.92■■□□□ 1.1
HDGFL2-208ENST00000616600 RLFQ13129 1914 aa21.92■■□□□ 1.1
HDGFL2-208ENST00000616600 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.92■■□□□ 1.1
HDGFL2-208ENST00000616600 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.92■■□□□ 1.1
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