RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 LDHAP00338 332 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CLTAP09496 248 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 GRM5P41594 1212 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CASP4P49662 377 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 YARSP54577 528 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 C9orf50Q5SZB4 431 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CREBRFQ8IUR6 639 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 HERVK_113Q902F9 699 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RNF19AQ9NV58 838 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 DMAC2Q9NW81 257 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 TET1Q8NFU7 2136 aa16.07■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF233A6NK53 670 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RECQL4O94761 1208 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 EOMESO95936 686 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CXCL8P10145 99 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FGFR1P11362 822 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF165P49910 485 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SHHQ15465 462 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 KYAT1Q16773 422 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC9A9Q8IVB4 645 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 AOPEPQ8N6M6 819 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 TMEM161AQ9NX61 479 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa16.06■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM189A1O60320 539 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 AKAP3O75969 853 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 GATMP50440 423 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF445P59923 1031 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 MYBPC2Q14324 1141 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 NFIL3Q16649 462 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC40Q4G0X9 1142 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SPATA1Q5VX52 437 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 AGMOQ6ZNB7 445 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 LRRC55Q6ZSA7 311 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 NPAS4Q8IUM7 802 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 HELQQ8TDG4 1101 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 GAD1Q99259 594 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 GDF15Q99988 308 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ANP32EQ9BTT0 268 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RSAD1Q9HA92 442 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa16.05■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 LTBP2Q14767 1821 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 BECN2A8MW95 431 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 LACTBL1A8MY62 500 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ADRB2P07550 413 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 MLH1P40692 756 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 MYL5Q02045 173 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SPAG1Q07617 926 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 GLB1LQ6UWU2 654 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ABI1Q8IZP0 508 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 TOP1MTQ969P6 601 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ZFP42Q96MM3 310 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CEP63Q96MT8 703 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RPS6KC1Q96S38 1066 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CXCL16Q9H2A7 254 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CBX8Q9HC52 389 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 UBN1Q9NPG3 1134 aa16.04■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ARL5CA6NH57 179 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 TBKBP1A7MCY6 615 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 SMTNL1A8MU46 457 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 KRT13P13646 458 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CYP24A1Q07973 514 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 GLRA4Q5JXX5 417 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CLLU1OSQ5K130 101 aa16.03■□□□□ 0.16
NPIPB11-202ENST00000614927 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms