RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 KCND2Q9NZV8 630 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 RAPGEF5Q92565 580 aa21.38■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
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CTDP1-208ENST00000613122 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 ABCB6Q9NP58 842 aa21.35■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 HMBSP08397 361 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM59Q8IWR1 403 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM55Q9BYV6 548 aa21.34■■□□□ 1.01
CTDP1-208ENST00000613122 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
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