RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PQ64 194 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PQD8 194 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 C2orf71A6NGG8 1288 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 GDF9O60383 454 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 LRP3O75074 770 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SLITRK3O94933 977 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 INSRRP14616 1297 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ABCD1P33897 745 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 STAT6P42226 847 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SPEM2Q0P670 501 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 XKR9Q5GH70 373 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 HYIQ5T013 277 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CATSPER3Q86XQ3 398 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 LMBR1Q8WVP7 490 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 RSAD2Q8WXG1 361 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 FOXQ1Q9C009 403 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CWH43Q9H720 699 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SETD4Q9NVD3 440 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 RGL1Q9NZL6 768 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CA14Q9ULX7 337 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 KIAA1024Q9UPX6 916 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 EVPLQ92817 2033 aa8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ASAP2O43150 1006 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TBC1D4O60343 1298 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 KRT18P05783 430 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SRFP11831 508 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SCP2P22307 547 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CMA1P23946 247 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 IGBP1P78318 339 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TFDP1Q14186 410 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PPP2R5AQ15172 486 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MTERF2Q49AM1 385 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ATAT1Q5SQI0 421 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 IER5Q5VY09 327 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 OTOP3Q7RTS5 596 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 METTL13Q8N6R0 699 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 GPR152Q8TDT2 470 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DRC1Q96MC2 740 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PCYT2Q99447 389 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 BCAS3Q9H6U6 928 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa8.61□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 H0YCG3 227 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 STK25O00506 426 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF862O60290 1169 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MED24O75448 989 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MYL1P05976 194 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TDGF1P13385 188 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CD52P31358 61 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 STARD6P59095 220 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 UBE2HP62256 183 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 IL17AQ16552 155 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 UGCGQ16739 394 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 RESP18Q5W5W9 173 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ANO5Q75V66 913 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SV2BQ7L1I2 683 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SLC44A3Q8N4M1 653 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 KIFAP3Q92845 792 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 GATA6Q92908 595 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 IFT74Q96LB3 600 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 SCLT1Q96NL6 688 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 CLIC6Q96NY7 704 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 MTRQ99707 1265 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 BHMT2Q9H2M3 363 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TNMDQ9H2S6 317 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 TMX1Q9H3N1 280 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 C17orf75Q9HAS0 396 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa8.6□□□□□ -1.03
ZNF548-208ENST00000597576 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms