RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584760.1

SREBF1-223, Transcript of sterol regulatory element binding transcription factor 1, human

TSL 2

Gene SREBF1, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SREBF1-223	ENST00000584760	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	ZBP1	Q9H171	429 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	S1PR5	Q9H228	398 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	MARCH5	Q9NX47	278 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	MIOS	Q9NXC5	875 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SREBF1-223	ENST00000584760	PLXNA3	P51805	1871 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	FSD2	A1L4K1	749 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760		K7ERI5	159 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	RECQL4	O94761	1208 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PLS3	P13797	630 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	KCNC3	Q14003	757 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SMC1A	Q14683	1233 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ATF7IP2	Q5U623	682 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	USP49	Q70CQ1	688 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TMC7	Q7Z402	723 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	VPS52	Q8N1B4	723 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	EPSTI1	Q96J88	318 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SFI1	A8K8P3	1242 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	NRP1	O14786	923 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SLC16A4	O15374	487 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	CTSA	P10619	480 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	GRIK3	Q13003	919 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SPECC1	Q5M775	1068 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	GPBP1	Q86WP2	473 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	RAD54L	Q92698	747 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	CLIC6	Q96NY7	704 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	REEP2	Q9BRK0	252 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SNTG2	Q9NY99	539 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	KLK14	Q9P0G3	267 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	DAXX	Q9UER7	740 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PARP2	Q9UGN5	583 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	VWA8	A3KMH1	1905 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ABLIM1	O14639	778 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PTGES	O14684	152 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	EFEMP2	O95967	443 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PROZ	P22891	400 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ZNF131	P52739	623 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	MCM6	Q14566	821 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	SLC39A14	Q15043	492 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	KREMEN2	Q8NCW0	462 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	KCNN1	Q92952	543 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	CDT1	Q9H211	546 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	CDH22	Q9UJ99	828 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	IRAK3	Q9Y616	596 aa		14.62	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760		F8W810	466 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ALDH2	P05091	517 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	OR1G1	P47890	313 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	NCKAP1L	P55160	1127 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PKP1	Q13835	747 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	PTPN14	Q15678	1187 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	KRI1	Q8N9T8	703 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		14.61	□□□□□ -0.07
SREBF1-223	ENST00000584760	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07

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