RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569151.1

BBS4-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 272 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-216	ENST00000569151	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	FAM26F	Q5R3K3	315 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	DAB2IP	Q5VWQ8	1189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	NLRP10	Q86W26	655 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TDRP	Q86YL5	185 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	CCDC65	Q8IXS2	484 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	LRRC43	Q8N309	656 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	LRRC15	Q8TF66	581 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	DYDC1	Q8WWB3	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MAIP1	Q8WWC4	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RAD54L	Q92698	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PTPRN2	Q92932	1015 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ART4	Q93070	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF333	Q96JL9	665 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MTMR9	Q96QG7	549 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	HAPLN3	Q96S86	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	DPH5	Q9H2P9	285 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	AZI2	Q9H6S1	392 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	GREM2	Q9H772	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ZWILCH	Q9H900	591 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	BLOC1S4	Q9NUP1	217 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	WHRN	Q9P202	907 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PHF24	Q9UPV7	400 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	COMMD3-BMI1	R4GMX3	469 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PASK	Q96RG2	1323 aa		4.93	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	CACNA1S	Q13698	1873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RGPD5	Q99666	1765 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MYMK	A6NI61	221 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MEN1	O00255	615 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PRMT3	O60678	531 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ATP2C2	O75185	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TJP3	O95049	919 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	STARD3NL	O95772	234 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	IL1B	P01584	269 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	FGG	P02679	453 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SHBG	P04278	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	BMP1	P13497	986 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	UCHL3	P15374	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	VCAM1	P19320	739 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	CYP7A1	P22680	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MARK3	P27448	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PTPN4	P29074	926 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	FLT3	P36888	993 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	PTGIR	P43119	386 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SCNN1D	P51172	638 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RAD23B	P54727	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	GDF10	P55107	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	XIAP	P98170	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ARHGAP4	P98171	946 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	COASY	Q13057	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	GRB10	Q13322	594 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MOGS	Q13724	837 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	STAT4	Q14765	748 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	TRADD	Q15628	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	MUM1	Q2TAK8	710 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
BBS4-216	ENST00000569151	VSTM1	Q6UX27	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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