RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566637.5

CTU2-208, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 1,619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-208ENST00000566637 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 EPC2Q52LR7 807 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SPAG5Q96R06 1193 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CGRRF1Q99675 332 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CDT1Q9H211 546 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 KCND1Q9NSA2 647 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 MYO6Q9UM54 1294 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 FHOD1Q9Y613 1164 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TNNI1P19237 187 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 RFX1P22670 979 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CDK17Q00537 523 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 RAPGEF1Q13905 1077 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SURF1Q15526 300 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 RSPH3Q86UC2 560 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CPB2Q96IY4 423 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 OSMRQ99650 979 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 PDZD7Q9H5P4 517 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 M0QZ92 97 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 ZSCAN12O43309 604 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 FAM189A1O60320 539 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 KYAT1Q16773 422 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SEZ6Q53EL9 994 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 WDR59Q6PJI9 974 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CATSPER4Q7RTX7 472 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SESTD1Q86VW0 696 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 THNSL1Q8IYQ7 743 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 VTI1AQ96AJ9 217 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 ADPGKQ9BRR6 497 aa22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TNFSF9P41273 254 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CLDN10P78369 228 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 MTF1Q14872 753 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 ASIC2Q16515 512 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 IQCEQ6IPM2 695 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 FBXL13Q8NEE6 735 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CHP1Q99653 195 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 MOXD2PA6NHM9 499 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 AP3M2P53677 418 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SV2AQ7L0J3 742 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 LMO3Q8TAP4 145 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 DNAJC12Q9UKB3 198 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 COQ4Q9Y3A0 265 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CCDC175P0C221 793 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 FGFR4P22455 802 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 ACLYP53396 1101 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 FMNL3Q8IVF7 1028 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.28■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CLTAP09496 248 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 CLCN1P35523 988 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 WNT7BP56706 349 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 BIRC3Q13489 604 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SNX17Q15036 470 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 GJB7Q6PEY0 223 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 WDR49Q8IV35 697 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 FAM212AQ96EL1 285 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.163e-6■■■■■ 32.8
CTU2-208ENST00000566637 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 RAB20Q9NX57 234 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.27■■□□□ 1.16
CTU2-208ENST00000566637 A0A1B0GUA9 196 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 USP27XA6NNY8 438 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 IL18RAPO95256 599 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 SERPING1P05155 500 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 AXLP30530 894 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 STAT1P42224 750 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 OSTNP61366 133 aa22.26■■□□□ 1.15
CTU2-208ENST00000566637 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
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