RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556343.1

ACTN1-218, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 3

Gene ACTN1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-218ENST00000556343 GRM5P41594 1212 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CASP4P49662 377 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ACOT2P49753 483 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CYP24A1Q07973 514 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 FAAP100Q0VG06 881 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 KCNH2Q12809 1159 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 LPIN1Q14693 890 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 NR1I3Q14994 352 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PSMD6Q15008 389 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 NT5DC4Q86YG4 428 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 BRSK2Q8IWQ3 736 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TRIM59Q8IWR1 403 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CCDC150Q8NCX0 1101 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TMEM40Q8WWA1 233 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 SEPT8Q92599 483 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 WNT8BQ93098 351 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CCDC127Q96BQ5 260 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 HTATIP2Q9BUP3 242 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 NUP58Q9BVL2 599 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CDT1Q9H211 546 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ASB7Q9H672 318 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ERVK-5Q9HDB9 667 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 UBN1Q9NPG3 1134 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 C1orf112Q9NSG2 853 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PADI3Q9ULW8 664 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 USP20Q9Y2K6 914 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 HTTP42858 3142 aa10.01□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 A0A1W2PQC6 194 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 XPOTO43592 962 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 DLATP10515 647 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ITGA4P13612 1032 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TNNI1P19237 187 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 EN2P19622 333 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CD52P31358 61 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CCDC173Q0VFZ6 552 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TRIM14Q14142 442 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 DUOXA2Q1HG44 320 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 EEF1DP3Q658K8 133 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 GBP6Q6ZN66 633 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CBWD2Q8IUF1 395 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TMEM199Q8N511 208 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PARD3BQ8TEW8 1205 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 FAM212AQ96EL1 285 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PARP2Q9UGN5 583 aa10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TTLL13PA6NNM8 815 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ABLIM1O14639 778 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PMM2O15305 246 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ZNF623O75123 536 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PHACTR2O75167 634 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 EOMESO95936 686 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TIMP1P01033 207 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TNNC2P02585 160 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 EDN1P05305 212 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 RAG1P15918 1043 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 MXI1P50539 228 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 OSTNP61366 133 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 LRRC26Q2I0M4 334 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 KRT39Q6A163 491 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 WDR49Q8IV35 697 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 SLC35C1Q96A29 364 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 BORCS6Q96GS4 357 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 FAM81BQ96LP2 452 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CGRRF1Q99675 332 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 ADAM2Q99965 735 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TMEM8AQ9HCN3 771 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 FAM105AQ9NUU6 356 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 SNTG2Q9NY99 539 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 IMPACTQ9P2X3 320 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 DERAQ9Y315 318 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa9.99□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CENPFP49454 3210 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 A0A0U1RQF3 1178 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 KIAA0355O15063 1070 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 NRDCO43847 1150 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 EFCAB14O75071 495 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 PFKMP08237 780 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 TMEM191BP0C7N4 346 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 FMO5P49326 533 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 CCL23P55773 120 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 MYL7Q01449 175 aa9.98□□□□□ -0.81
ACTN1-218ENST00000556343 BIRC3Q13489 604 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.4 ms