RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB33A	Q14088	237 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	WTAP	Q15007	396 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	GPR142	Q7Z601	462 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	C12orf42	Q96LP6	360 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC14	Q96N46	770 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MMP19	Q99542	508 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	CPVL	Q9H3G5	476 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	AKT3	Q9Y243	479 aa		5.4	□□□□□ -1.54
ATXN3-238	ENST00000556288	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		5.4	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM82	A0PJX8	343 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PRC1	O43663	620 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CNMD	O75829	334 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	REC8	O95072	547 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF205	O95201	554 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A27	O95847	323 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PGK2	P07205	417 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL5	P13501	91 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RAC2	P15153	192 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MCM5	P33992	734 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS2	P41220	211 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	AFM	P43652	599 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DUSP4	Q13115	394 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KCTD2	Q14681	263 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DDR2	Q16832	855 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	USH1G	Q495M9	461 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SV2C	Q496J9	727 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ZPBP2	Q6X784	338 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM160B2	Q86V87	743 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DGKH	Q86XP1	1220 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MB21D1	Q8N884	522 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	DCAF4	Q8WV16	495 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ARMC5	Q96C12	935 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	NEK1	Q96PY6	1258 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC12A9	Q9BXP2	914 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MROH8	Q9H579	483 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC5A4	Q9NY91	659 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	TNKS	O95271	1327 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ZMYM6	O95789	1325 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RBBP6	Q7Z6E9	1792 aa	Known RBP	5.39	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR81	Q562E7	1941 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KLRF2	D3W0D1	207 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	STRN	O43815	780 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	SUSD5	O60279	629 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CD3E	P07766	207 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CPA1	P15085	419 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RXRA	P19793	462 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ADORA2A	P29274	412 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ERVFC1	P60507	584 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	RBL2	Q08999	1139 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	NECTIN1	Q15223	517 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	CCL14	Q16627	93 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	ANO1	Q5XXA6	986 aa		5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	MRM1	Q6IN84	353 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.38	□□□□□ -1.55

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