RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555995.1

CCDC88C-210, Transcript of coiled-coil domain containing 88C, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC88C, Length 689 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88C-210ENST00000555995 KLK14Q9P0G3 267 aa22.63■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 PROZP22891 400 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 CA8P35219 290 aa22.62■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 LRRC15Q8TF66 581 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 ZHX3Q9H4I2 956 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 PTPRHQ9HD43 1115 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 MIOSQ9NXC5 875 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 CD207Q9UJ71 328 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 GDAQ9Y2T3 454 aa22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa22.62■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 B4GALT3O60512 393 aa22.61■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 GAP43P17677 238 aa22.61■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.61■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa22.61■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 A0A0C4DFX4 3053 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 CLDN3O15551 220 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 CXCL14O95715 111 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 URODP06132 367 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 COASYQ13057 564 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 PPFIBP1Q86W92 1011 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 CASP10Q92851 521 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 HVCN1Q96D96 273 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 MAGEF1Q9HAY2 307 aa22.6■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 SLC38A7Q9NVC3 462 aa22.6■■□□□ 1.21
CCDC88C-210ENST00000555995 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa22.6■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 USP20Q9Y2K6 914 aa22.6■■□□□ 1.21
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CCDC88C-210ENST00000555995 GTF2BQ00403 316 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 ALCAMQ13740 583 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 PKP1Q13835 747 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 FUT10Q6P4F1 479 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 DYMQ7RTS9 669 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 MAP4K3Q8IVH8 894 aa22.57■■□□□ 1.2
CCDC88C-210ENST00000555995 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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