RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUFT1Q9NNX1 390 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KLK14Q9P0G3 267 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EPS15L1Q9UBC2 864 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FBXL21Q9UKT6 434 aa21.46■■□□□ 1.03
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LRRIQ4A6NIV6 560 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USO1O60763 962 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TADA2AO75478 443 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RFPL2O75678 378 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31D3P0C874 917 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NPR3P17342 541 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 AOC1P19801 751 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCM7P33993 719 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NBL1P41271 181 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CREMQ03060 361 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCTP1Q6DN14 999 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LILRA6Q6PI73 481 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAEAQ7L5Y9 396 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NACC1Q96RE7 527 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FZD8Q9H461 694 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLUHO75153 1309 aa21.45■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DMDP11532 3685 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POTEMA6NI47 508 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TGM5O43548 720 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYBP10242 640 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM187BQ17R55 369 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTC38Q5R3I4 469 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 B3GALT6Q96L58 329 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RTP3Q9BQQ7 232 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PIDD1Q9HB75 910 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WNT16Q9UBV4 365 aa21.44■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PI15O43692 258 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TUSC3Q13454 348 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIX5Q8N196 739 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC44A3Q8N4M1 653 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYADMQ96S97 322 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRKD2Q9BZL6 878 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C2orf40Q9H1Z8 148 aa21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C2orf16Q68DN1 1984 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ERMNQ8TAM6 284 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RSAD2Q8WXG1 361 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RABGGTAQ92696 567 aa21.42■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 N4BP3O15049 544 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 NARSO43776 548 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MED24O75448 989 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OR52Z1P0C646 297 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDCP20941 246 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF174Q15697 407 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAPK6Q16659 721 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ASCL5Q7RTU5 278 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCDC105Q8IYK2 499 aa21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZMYND10O75800 440 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 THP07101 528 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMP2P13473 410 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CYP11B2P19099 503 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPA1P27694 616 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PADI6Q6TGC4 694 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLYCTKQ8IVS8 523 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HSCBQ8IWL3 235 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DTWD2Q8NBA8 298 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAAF1Q9BRP4 392 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTPALQ9BTX7 342 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB34Q9BZG1 259 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDZD7Q9H5P4 517 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SNTG2Q9NY99 539 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLXNA3P51805 1871 aa21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRR23AA6NEV1 266 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STK25O00506 426 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACKR2O00590 384 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CFHP08603 1231 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SRFP11831 508 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM132AQ24JP5 1023 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RTP2Q5QGT7 225 aa21.39■■□□□ 1.01
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FAM171A1Q5VUB5 890 aa21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms