RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NRSN2Q9GZP1 204 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 RNF208Q9H0X6 261 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 C2orf40Q9H1Z8 148 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PCIF1Q9H4Z3 704 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SP110Q9HB58 689 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 CATSPERZQ9NTU4 200 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 COMMD8Q9NX08 183 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TMOD4Q9NZQ9 345 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 CRIM1Q9NZV1 1036 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 POGKQ9P215 609 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 FBXL21Q9UKT6 434 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 FHOD1Q9Y613 1164 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PASKQ96RG2 1323 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 A0A1W2PPC4 97 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SLC12A8A0AV02 714 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 MEGF11A6BM72 1044 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ISM1B1AKI9 464 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 H0Y626 953 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TRIM38O00635 465 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 AP3D1O14617 1153 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 WNT9AO14904 365 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TSPAN3O60637 253 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TSPAN9O75954 239 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 CLTBP09497 229 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 CCDC159P0C7I6 412 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PORP16435 677 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 IL11P20809 199 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 BCAR1P56945 870 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ZNF445P59923 1031 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 RNF4P78317 190 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TMED1Q13445 227 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 FGL2Q14314 439 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TNIP1Q15025 636 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 UGT8Q16880 541 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 KIZQ2M2Z5 673 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ZBTB37Q5TC79 503 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 KLHL10Q6JEL2 608 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ACAD10Q6JQN1 1059 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NFXL1Q6ZNB6 911 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ZNF765Q7L2R6 523 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SLC51AQ86UW1 340 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 EGFL6Q8IUX8 553 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 OR8H3Q8N146 312 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NUP93Q8N1F7 819 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NGEFQ8N5V2 710 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 POU5F2Q8N7G0 328 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TTLL11Q8NHH1 800 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 GSDMBQ8TAX9 411 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SPATA18Q8TC71 538 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TAF4BQ92750 862 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 KCNC2Q96PR1 638 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PTPN18Q99952 460 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 EDEM3Q9BZQ6 932 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 OR10A4Q9H209 315 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SYNCQ9H7C4 482 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SPON1Q9HCB6 807 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SAYSD1Q9NPB0 183 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 TM7SF3Q9NS93 570 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 KCND1Q9NSA2 647 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 HPF1Q9NWY4 346 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 RPS6KA6Q9UK32 745 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 USP21Q9UK80 565 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 GTF3C4Q9UKN8 822 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NR2E3Q9Y5X4 410 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ATP23Q9Y6H3 246 aa3.93□□□□□ -1.78
CS-232ENST00000552331 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms