RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	TREH	O43280	583 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	OFD1	O75665	1012 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	WNT7B	P56706	349 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	GJB7	Q6PEY0	223 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	SV2A	Q7L0J3	742 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF516	Q92618	1163 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	STK33	Q9BYT3	514 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP1CC-208	ENST00000551676	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SERPING1	P05155	500 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	MAPK8IP2	Q13387	824 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SPAG5	Q96R06	1193 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	FNBP1	Q96RU3	617 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDT1	Q9H211	546 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SSU72P8	A0A1W2PR75	194 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	NME8	Q8N427	588 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SCLT1	Q96NL6	688 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	DDX20	Q9UHI6	824 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNAJC12	Q9UKB3	198 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSPAN1	O60635	241 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	MCF2	P10911	925 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEMA4D	Q92854	862 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CGRRF1	Q99675	332 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNFSF9	P41273	254 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTPN14	Q15678	1187 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASIC2	Q16515	512 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZACN	Q401N2	412 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEZ6	Q53EL9	994 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC42	Q96M95	316 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SURF1	Q15526	300 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	KCNA10	Q16322	511 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	RAB20	Q9NX57	234 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTPRJ	Q12913	1337 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676		A0A1B0GUA9	196 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRN2	O75325	713 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNNI1	P19237	187 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PRKCI	P41743	596 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	STAT1	P42224	750 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	AP3M2	P53677	418 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	SESTD1	Q86VW0	696 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPR88	Q9GZN0	384 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676		F8VZ95	297 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	LCA5L	O95447	670 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ASGR1	P07306	291 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	DRAP1	Q14919	205 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	CPB2	Q96IY4	423 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERLIN2	O94905	339 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TUBB4A	P04350	444 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNNT1	P13805	278 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP1CC-208	ENST00000551676	KRT83	P78385	493 aa		27.83	■■■□□ 2.05

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