RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 GAP43P17677 238 aa25.52■■□□□ 1.68
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CTDSP2-203ENST00000547701 MCL1Q07820 350 aa25.52■■□□□ 1.68
CTDSP2-203ENST00000547701 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CTDSP2-203ENST00000547701 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa25.52■■□□□ 1.68
CTDSP2-203ENST00000547701 TCF25Q9BQ70 676 aa25.52■■□□□ 1.68
CTDSP2-203ENST00000547701 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.52■■□□□ 1.68
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CTDSP2-203ENST00000547701 TBX20Q9UMR3 447 aa25.52■■□□□ 1.68
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CTDSP2-203ENST00000547701 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 VPS52Q8N1B4 723 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa25.5■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 VN1R3Q9BXE9 311 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 TLE6Q9H808 572 aa25.5■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 KRT85P78386 507 aa25.49■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 MUC3AQ02505 3323 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 CLDND1Q9NY35 253 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 KLK14Q9P0G3 267 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 K7ENM7 598 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 ADRB2P07550 413 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 NRIP1P48552 1158 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 DYMQ7RTS9 669 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 PANK2Q9BZ23 570 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 CHST7Q9NS84 486 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 CNTN3Q9P232 1028 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDSP2-203ENST00000547701 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP25.46■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 YARSP54577 528 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 PLPP4Q5VZY2 271 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 PDILTQ8N807 584 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 CEP120Q8N960 986 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 UROC1Q96N76 676 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM13BQ9NYF5 915 aa25.46■■□□□ 1.67
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