RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 FTCDO95954 541 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TGFB2P61812 414 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 KRT17Q04695 432 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 P3H1Q32P28 736 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ACCSLQ4AC99 568 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PDXDC1Q6P996 788 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 SNF8Q96H20 258 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 NYAP2Q9P242 653 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 POTEMA6NI47 508 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC6O75061 913 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PRKCBP05771 671 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 GCLMP48507 274 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CACNB3P54284 484 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 MAPRE2Q15555 327 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 YY1AP1Q9H869 796 aa6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 FGGP02679 453 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 STAG3L1P0CL83 205 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 CYP2D6P10635 497 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 RASSF3Q86WH2 238 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 NEUROG2Q9H2A3 272 aa6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PDE4D-226ENST00000546160 H7C4K7 107 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF197O14709 1029 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CTIFO43310 598 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MTSS1O43312 755 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NME3Q13232 169 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SCARF1Q14162 830 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SCFD2Q8WU76 684 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 C18orf8Q96DM3 657 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 STK33Q9BYT3 514 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FAM129AQ9BZQ8 928 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ANKEF1Q9NU02 776 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TPI1P60174 286 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 BBS9Q3SYG4 887 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GLB1LQ6UWU2 654 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ATP11CQ8NB49 1132 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SEPT1Q8WYJ6 367 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MAML1Q92585 1016 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SAYSD1Q9NPB0 183 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HOXA2O43364 376 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 NR1D1P20393 614 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 IL1RL1Q01638 556 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PASD1Q8IV76 773 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PBXIP1Q96AQ6 731 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 GRAMD1AQ96CP6 724 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 VCPKMTQ9H867 229 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MON2Q7Z3U7 1717 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EMSYQ7Z589 1322 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PHLPP1O60346 1717 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HNRNPCL1O60812 293 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ANP32DO95626 131 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ITGA4P13612 1032 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MED21Q13503 144 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 RNF149Q8NC42 400 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 BFARQ9NZS9 450 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 TBK1Q9UHD2 729 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF609O15014 1411 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 SMAPO00193 183 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PRRG1O14668 218 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MORF4L2Q15014 288 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 BCAR1P56945 870 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PKP1Q13835 747 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 MTHFD1LQ6UB35 978 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 HAUS6Q7Z4H7 955 aa6.76□□□□□ -1.33
PDE4D-226ENST00000546160 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms