RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545015.1

POLE-222, Transcript of DNA polymerase epsilon, catalytic subunit, human

TSL 2

Gene POLE, Length 366 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLE-222	ENST00000545015	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	KLK14	Q9P0G3	267 aa		14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	USP20	Q9Y2K6	914 aa		14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	SFI1	A8K8P3	1242 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015		H0YCG3	227 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	SLC16A4	O15374	487 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	TH	P07101	528 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	MCF2	P10911	925 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	PLCG1	P19174	1290 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	NCKAP1L	P55160	1127 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	ITIH3	Q06033	890 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	SLC39A14	Q15043	492 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	ZPBP2	Q6X784	338 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	RAD54L	Q92698	747 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	PLIN2	Q99541	437 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	CDT1	Q9H211	546 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		14.72	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	TMEM189-UBE2V1	I3L0A0	370 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	TOM1L1	O75674	476 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	PAPLN	O95428	1278 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	UROD	P06132	367 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	LIG1	P18858	919 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	DDIT3	P35638	169 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	GLUD2	P49448	558 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	CLCN4	P51793	760 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	FUT10	Q6P4F1	479 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	PPP1R10	Q96QC0	940 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	USP28	Q96RU2	1077 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	REEP2	Q9BRK0	252 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015	STK17A	Q9UEE5	414 aa		14.71	□□□□□ -0.05
POLE-222	ENST00000545015		F8W810	466 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	GPR37L1	O60883	481 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	PIGR	P01833	764 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	ALAD	P13716	330 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	ABCD1	P33897	745 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	STRN3	Q13033	797 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	USP41	Q3LFD5	358 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	MPZL3	Q6UWV2	235 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	USP49	Q70CQ1	688 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	GPBP1	Q86WP2	473 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	EPSTI1	Q96J88	318 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	FIZ1	Q96SL8	496 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	FNIP2	Q9P278	1114 aa		14.7	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	ADH1A	P07327	375 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	KCNE1	P15382	129 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	EPCAM	P16422	314 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	CREM	Q03060	361 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	MCL1	Q07820	350 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	MCM6	Q14566	821 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	HSCB	Q8IWL3	235 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	CEP120	Q8N960	986 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	FBXL18	Q96ME1	805 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	UROC1	Q96N76	676 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	ST6GALNAC4	Q9H4F1	302 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	PARVG	Q9HBI0	331 aa		14.69	□□□□□ -0.06
POLE-222	ENST00000545015	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		14.69	□□□□□ -0.06

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms