RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531691.5

TXNRD1-223, Transcript of thioredoxin reductase 1, human

TSL 2

Gene TXNRD1, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TXNRD1-223	ENST00000531691	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF20	Q5VTR2	975 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	ANO5	Q75V66	913 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	RTL10	Q7L3V2	364 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	TCP11	Q8WWU5	503 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNASE1L2	Q92874	299 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZFP42	Q96MM3	310 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	CHRD	Q9H2X0	955 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TXNRD1-223	ENST00000531691	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CNR2	P34972	360 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	RFC5	P40937	340 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	SHC2	P98077	582 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	FZD5	Q13467	585 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691		Q4G0T1	1027 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CEP57	Q86XR8	500 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	RNF149	Q8NC42	400 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CCDC148	Q8NFR7	591 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	TMEM143	Q96AN5	459 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CEP170P1	Q96L14	293 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	APOL6	Q9BWW8	343 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CSRNP2	Q9H175	543 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	MIOS	Q9NXC5	875 aa		12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	TDGF1	P13385	188 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PML	P29590	882 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CDC27	P30260	824 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CXCL12	P48061	93 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	FGD1	P98174	961 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	GRIK3	Q13003	919 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PSMD5	Q16401	504 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	RTP2	Q5QGT7	225 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PLA2G4F	Q68DD2	849 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	GJA10	Q969M2	543 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	MCRS1	Q96EZ8	462 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	BRD9	Q9H8M2	597 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	HES2	Q9Y543	173 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		12.44	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	F5	P12259	2224 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	TSPAN1	O60635	241 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	NPEPPS	P55786	919 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	TFDP1	Q14186	410 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ACAP1	Q15027	740 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	NECTIN1	Q15223	517 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	OTUD6A	Q7L8S5	288 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	FERMT3	Q86UX7	667 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	ING5	Q8WYH8	240 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	FAM3C	Q92520	227 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	IRF7	Q92985	503 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PARP2	Q9UGN5	583 aa		12.43	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	GDF9	O60383	454 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PROS1	P07225	676 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	AKAP5	P24588	427 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	LIMK1	P53667	647 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	PTEN	P60484	403 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	TUSC3	Q13454	348 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	RAB33A	Q14088	237 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CEP68	Q76N32	757 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	TBCK	Q8TEA7	893 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	RABGGTA	Q92696	567 aa		12.42	□□□□□ -0.42
TXNRD1-223	ENST00000531691	CPB2	Q96IY4	423 aa		12.42	□□□□□ -0.42

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms