RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 GDAQ9Y2T3 454 aa20.83■□□□□ 0.93
PACSIN3-208ENST00000531226 BRWD1Q9NSI6 2320 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 COL6A3P12111 3177 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 GALTP07902 379 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAJB1P25685 340 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 SYKP43405 635 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 LIG4P49917 911 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 MCL1Q07820 350 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 DSC1Q08554 894 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 GRIK3Q13003 919 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CAMK1Q14012 370 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TIGD5Q53EQ6 642 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PPM1EQ8WY54 764 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 STRA6Q9BX79 667 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CHMP5Q9NZZ3 219 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TBC1D7Q9P0N9 293 aa20.82■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CLDN3O15551 220 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 GCNT3O95395 438 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 AFMP43652 599 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC11A1P49279 550 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 NDUFA8P51970 172 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ALCAMQ13740 583 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 COLGALT2Q8IYK4 626 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 LZTS1Q9Y250 596 aa20.81■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PTGESO14684 152 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CASP1P29466 404 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CASP5P51878 434 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC39A4Q6P5W5 647 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 UNC13DQ70J99 1090 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TLR9Q9NR96 1032 aa20.8■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CSPG5O95196 566 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 MYBP10242 640 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 OSTNP61366 133 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT17Q04695 432 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CUL4BQ13620 913 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PAGE5Q96GU1 130 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM169Q96HH4 297 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 IGSF21Q96ID5 467 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ACAP3Q96P50 834 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa20.79■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 EYSQ5T1H1 3165 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ALDH2P05091 517 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 THP07101 528 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 IRS1P35568 1242 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 EHHADHQ08426 723 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 XKR4Q5GH76 650 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 SNX27Q96L92 541 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ACCSQ96QU6 501 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 FAN1Q9Y2M0 1017 aa20.78■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 VWA8A3KMH1 1905 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 A0A0B4J269 797 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ANKRD63C9JTQ0 380 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 NRP1O14786 923 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 MYL1P05976 194 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 OR1G1P47890 313 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNA1Q09470 495 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TUSC3Q13454 348 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 TCEAL5Q5H9L2 206 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM26FQ5R3K3 315 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 HPS3Q969F9 1004 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 MARCH5Q9NX47 278 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 REV3LO60673 3130 aa20.77■□□□□ 0.92
PACSIN3-208ENST00000531226 FSCN2O14926 492 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 OGTO15294 1046 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM189A1O60320 539 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 NR1I2O75469 434 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF202O95125 648 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 ERVFC1P60507 584 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 NAB2Q15742 525 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 KYAT1Q16773 422 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SEZ6Q53EL9 994 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.76■□□□□ 0.91
PACSIN3-208ENST00000531226 SLFN12LQ6IEE8 588 aa20.76■□□□□ 0.91
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