RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR72	Q3MJ13	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCGF5	Q86SE9	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ACAP3	Q96P50	834 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXB1	Q99853	325 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	DNM3	Q9UQ16	869 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PIP5K1C	O60331	668 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RHCE	P18577	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PTGS1	P23219	599 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RHD	Q02161	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH6A1	Q02252	535 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPRE1	Q15691	268 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KANSL1	Q7Z3B3	1105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TPP1	O14773	563 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ARHGAP6	O43182	974 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ENPP1	P22413	925 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MSX2	P35548	267 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ETV4	P43268	484 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	USP14	P54578	494 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TRIM14	Q14142	442 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	LLGL1	Q15334	1064 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TTC38	Q5R3I4	469 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MIER2	Q8N344	545 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	HIPK4	Q8NE63	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MSL2	Q9HCI7	577 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TLR9	Q9NR96	1032 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO10	Q9UK96	956 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		4.85	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS38	A1L453	326 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702		A6NNZ2	444 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	HMGCR	P04035	888 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MAN1A1	P33908	653 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	MTNR1B	P49286	362 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	RGS3	P49796	1198 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNQ1	P51787	676 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	FOXL1	Q12952	345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	NFYC	Q13952	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		4.84	□□□□□ -1.63
FAM49B-222	ENST00000522702	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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