RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 CTSAP10619 480 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 HAUS6Q7Z4H7 955 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 ZBTB33Q86T24 672 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 AUTS2Q8WXX7 1259 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 PANK2Q9BZ23 570 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 STK39Q9UEW8 545 aa28.1■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 GRXCR2A6NFK2 248 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 PTGESO14684 152 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 IL9P15248 144 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 PROZP22891 400 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 STAT6P42226 847 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 RBM10P98175 930 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 MPZL3Q6UWV2 235 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 CEP120Q8N960 986 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 COLEC11Q9BWP8 271 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 CXCL16Q9H2A7 254 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 CLEC1BQ9P126 229 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 CD207Q9UJ71 328 aa28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 K7ENM7 598 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 TRAK2O60296 914 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 THP07101 528 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 MCF2P10911 925 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 GRM5P41594 1212 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 TUSC3Q13454 348 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 SV2BQ7L1I2 683 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 DYMQ7RTS9 669 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 VN1R2Q8NFZ6 395 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 MSLNLQ96KJ4 702 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 FAM50BQ9Y247 325 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 IRAK3Q9Y616 596 aa28.08■■■□□ 2.09
TCEA1-202ENST00000517351 A0A087X0B3 334 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ABLIM1O14639 778 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 CUTAO60888 179 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TOM1L1O75674 476 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 HARSP12081 509 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 OSTNP61366 133 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ATL3Q6DD88 541 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ZPBP2Q6X784 338 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 PDILTQ8N807 584 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM87AQ8NBN3 555 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 KCNN1Q92952 543 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa28.07■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 F8W810 466 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 BRD1O95696 1058 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SRGAP2BP0DMP2 458 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SCP2P22307 547 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 YARSP54577 528 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 KCNC3Q14003 757 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 LLGL2Q6P1M3 1020 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 FAM178BQ8IXR5 827 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 DDX12PQ92771 950 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 BICD1Q96G01 975 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 CACNG4Q9UBN1 327 aa28.06■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 CASTOR2A6NHX0 329 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 MYMKA6NI61 221 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TNFRSF10AO00220 468 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 MBTPS2O43462 519 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SOD2P04179 222 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 PTPN14Q15678 1187 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 GLRA4Q5JXX5 417 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 KCNG4Q8TDN1 519 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 RABGGTAQ92696 567 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 FIZ1Q96SL8 496 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 CFAP45Q9UL16 551 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TBX20Q9UMR3 447 aa28.05■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 NMT1P30419 496 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 COASYQ13057 564 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 NAB2Q15742 525 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ACAP3Q96P50 834 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 PAAF1Q9BRP4 392 aa28.04■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 CLDN3O15551 220 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 URODP06132 367 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 LIG4P49917 911 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 FUT10Q6P4F1 479 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SHC4Q6S5L8 630 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TAS1R1Q7RTX1 841 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SFR1Q86XK3 245 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SMRP1Q8NCR6 262 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ADAM28Q9UKQ2 775 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 TADA2AO75478 443 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 EFEMP2O95967 443 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ABCD1P33897 745 aa28.02■■■□□ 2.08
TCEA1-202ENST00000517351 ME1P48163 572 aa28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms