RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516226.1

RNU6-397P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 397, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-397P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-397P-201ENST00000516226 BOD1Q96IK1 185 aa3.28□□□□□ -1.88
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RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM74BQ9NUR3 256 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 LRIT1Q9P2V4 623 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-397P-201ENST00000516226 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MYADML2A6NDP7 307 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ITGA10O75578 1167 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CLRN1P58418 232 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SART3Q15020 963 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM47AQ5JRC9 791 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 Q6ZNX1 250 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 C11orf74Q86VG3 221 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 THNSL2Q86YJ6 484 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 LILRB2Q8N423 598 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SLC44A3Q8N4M1 653 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNPEPQ9H4A4 650 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 GALNT9Q9HCQ5 603 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPRC5DQ9NZD1 345 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PRSS50Q9UI38 385 aa3.27□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CCDC151A5D8V7 595 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZFPL1O95159 310 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 RBM25P49756 843 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MANFP55145 182 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
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RNU6-397P-201ENST00000516226 C1QL2Q7Z5L3 287 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 AHI1Q8N157 1196 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PPM1KQ8N3J5 372 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 OR56A1Q8NGH5 318 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCARB1Q8WTV0 552 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 OSBPL2Q9H1P3 480 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM260Q9NX78 707 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.26□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CDY2AQ9Y6F7 541 aa3.26□□□□□ -1.89
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RNU6-397P-201ENST00000516226 DRGXA6NNA5 263 aa3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-397P-201ENST00000516226 LSSP48449 732 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SOX10P56693 466 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCAPQ12770 1279 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SP140Q13342 867 aa3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-397P-201ENST00000516226 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 KLHL11Q9NVR0 708 aa3.25□□□□□ -1.89
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RNU6-397P-201ENST00000516226 ZMYM3Q14202 1370 aa3.25□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
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RNU6-397P-201ENST00000516226 TMEM127O75204 238 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 WT1P19544 449 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CTSSP25774 331 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SCNN1BP51168 640 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 NEK4P51957 841 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CHN2P52757 468 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 PTTG1IPP53801 180 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 KRTAP10-9P60411 292 aa3.24□□□□□ -1.89
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RNU6-397P-201ENST00000516226 TERF2Q15554 542 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 TCEA2Q15560 299 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MST1LQ2TV78 715 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ANKS6Q68DC2 871 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 GPR149Q86SP6 731 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 RNF169Q8NCN4 708 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 SMC1BQ8NDV3 1235 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MDM1Q8TC05 714 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ACTRT2Q8TDY3 377 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 ZNF384Q8TF68 577 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 UROC1Q96N76 676 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 BCO1Q9HAY6 547 aa3.24□□□□□ -1.89
RNU6-397P-201ENST00000516226 CASS4Q9NQ75 786 aa3.24□□□□□ -1.89
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