RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514153.5

FAM149A-215, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, human

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene FAM149A, Length 2,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM149A-215	ENST00000514153	STX10	O60499	249 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	PSMD6	Q15008	389 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	GJB7	Q6PEY0	223 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	FNBP1	Q96RU3	617 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	LRRC53	A6NM62	1247 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	MTF1	Q14872	753 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	USP37	Q86T82	979 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	MCCD1	P59942	119 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	33.15	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	PTPRJ	Q12913	1337 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	N4BP1	O75113	896 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	UCHL3	P15374	230 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	ITGA7	Q13683	1181 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	TSR1	Q2NL82	804 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	WDR59	Q6PJI9	974 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	FAM212A	Q96EL1	285 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	TNNI1	P19237	187 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	SNX17	Q15036	470 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	TMEM192	Q8IY95	271 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	ZNF516	Q92618	1163 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	CHP1	Q99653	195 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FAM149A-215	ENST00000514153	NME8	Q8N427	588 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	ARHGAP6	O43182	974 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CETN1	Q12798	172 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	MTFR1	Q15390	333 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	PTGIS	Q16647	500 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	EPC2	Q52LR7	807 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	KRT39	Q6A163	491 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	LMO3	Q8TAP4	145 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CTSH	P09668	335 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	PDXDC1	Q6P996	788 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	SV2A	Q7L0J3	742 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	SERINC5	Q86VE9	423 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	SESTD1	Q86VW0	696 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	33.12	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	FECH	P22830	423 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	TRMT13	Q9NUP7	481 aa	Known RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153		A0A1B0GUA9	196 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	MOXD2P	A6NHM9	499 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	P4HA2	O15460	535 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CABYR	O75952	493 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	SEMA4D	Q92854	862 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	USP27X	A6NNY8	438 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	IQCE	Q6IPM2	695 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CELF4	Q9BZC1	486 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	MCF2	P10911	925 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CLDN10	P78369	228 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153		A0A1W2PQY0	241 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CXCL8	P10145	99 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	GTF2H1	P32780	548 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	ENPEP	Q07075	957 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	MEA1	Q16626	185 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	TMTC1	Q8IUR5	882 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	DESI2	Q9BSY9	194 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	RSPH3	Q86UC2	560 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	CGRRF1	Q99675	332 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	APEX2	Q9UBZ4	518 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153		M0QZ92	97 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	STAG3L1	P0CL83	205 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FAM149A-215	ENST00000514153	DEFB118	Q96PH6	123 aa		33.08	■■■□□ 2.89

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