RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 TUSC3Q13454 348 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 MAPK6Q16659 721 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CYP26C1Q6V0L0 522 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NOSTRINQ8IVI9 506 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 GPR65Q8IYL9 337 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 HDAC7Q8WUI4 952 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CCDC113Q9H0I3 377 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CXCL16Q9H2A7 254 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 POLD4Q9HCU8 107 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 FNIP2Q9P278 1114 aa18.69■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ACKR2O00590 384 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PTGESO14684 152 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 RECQL4O94761 1208 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 EDN1P05305 212 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NAMPTP43490 491 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NBR1Q14596 966 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ECM1Q16610 540 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 C4orf32Q8N8J7 132 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 DEPTORQ8TB45 409 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 HASPINQ8TF76 798 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 STAMQ92783 540 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CLUHO75153 1309 aa18.68■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 C1RP00736 705 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 MUTP22033 750 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 TRAPPC10P48553 1259 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PPP2R5AQ15172 486 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 RTP2Q5QGT7 225 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 EEF1DP3Q658K8 133 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 HAUS3Q68CZ6 603 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 LILRA6Q6PI73 481 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 FAM184AQ8NB25 1140 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ADPGKQ9BRR6 497 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 KIFC3Q9BVG8 833 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NT5C3AQ9H0P0 336 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 BHMT2Q9H2M3 363 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PIDD1Q9HB75 910 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 IGSF9Q9P2J2 1179 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 DUSP12Q9UNI6 340 aa18.67■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.67■□□□□ 0.581e-8■■■■■ 103.4
HERC3-211ENST00000513325 KIF4AO95239 1232 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PAPLNO95428 1278 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 THP07101 528 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CLCN5P51795 746 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CREMQ03060 361 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 FLCNQ8NFG4 579 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 RSAD2Q8WXG1 361 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 MYADMQ96S97 322 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 LRWD1Q9UFC0 647 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 GDAQ9Y2T3 454 aa18.66■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NARSO43776 548 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NAB2Q15742 525 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 NT5DC1Q5TFE4 455 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 CEP57Q86XR8 500 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 IFT74Q96LB3 600 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 KIF2CQ99661 725 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 TTPALQ9BTX7 342 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 PRKD2Q9BZL6 878 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 EPS15L1Q9UBC2 864 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 FBXL21Q9UKT6 434 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 KIAA1024Q9UPX6 916 aa18.65■□□□□ 0.58
HERC3-211ENST00000513325 ZMYND10O75800 440 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 NPR3P17342 541 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 EFNA5P52803 228 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PSMD5Q16401 504 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 SIX5Q8N196 739 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PIK3R5Q8WYR1 880 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 KIFAP3Q92845 792 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 CLSTN3Q9BQT9 956 aa18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PI15O43692 258 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 GFRA3O60609 400 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PTGDRQ13258 359 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 PDIA5Q14554 519 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 GLRA4Q5JXX5 417 aa18.63■□□□□ 0.57
HERC3-211ENST00000513325 ATF7IP2Q5U623 682 aa18.63■□□□□ 0.57
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