RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511754.5

TNPO1-208, Transcript of transportin 1, human

TSL 5

Gene TNPO1, Length 433 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TNPO1-208	ENST00000511754	TTC1	Q99614	292 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	IFT22	Q9H7X7	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ZEB2	O60315	1214 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	TMEM127	O75204	238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PTPN7	P35236	360 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	SESN3	P58005	492 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754		Q6YL49	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	SYT12	Q8IV01	421 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	RNF169	Q8NCN4	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754		A0A087X0B3	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	AKR1B10	O60218	316 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	HKR1	P10072	659 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	BPI	P17213	487 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FLT3LG	P49771	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PDCD1	Q15116	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	DPP7	Q9UHL4	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	USP15	Q9Y4E8	981 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ZNF185	O15231	689 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PJA2	O43164	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ERBB2	P04626	1255 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ITGB6	P18564	788 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ENPP1	P22413	925 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CLRN1	P58418	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CDK17	Q00537	523 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CPEB4	Q17RY0	729 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	UNC119B	A6NIH7	251 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	DRGX	A6NNA5	263 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	NEMP1	O14524	444 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ENPP3	O14638	875 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	MTHFD2	P13995	350 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PER3	P56645	1201 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	STRN3	Q13033	797 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	REST	Q13127	1097 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ADGRG3	Q86Y34	549 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	GPR156	Q8NFN8	814 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FATE1	Q969F0	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	TEX101	Q9BY14	249 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	BCO1	Q9HAY6	547 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	DKK2	Q9UBU2	259 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CD38	P28907	300 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	ECHS1	P30084	290 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	CHN2	P52757	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	GYS2	P54840	703 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	OR7D4	Q8NG98	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TNPO1-208	ENST00000511754	SYBU	Q9NX95	663 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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