RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 NSMFQ6X4W1 530 aa29.03■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC34Q8IZ02 419 aa29.03■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 YDJCA8MPS7 323 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 ECEL1O95672 775 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 CDR2Q01850 454 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 SPP2Q13103 211 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R7Q15435 360 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 TKFCQ3LXA3 575 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 IWS1Q96ST2 819 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 MTFR1LQ9H019 292 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 SPDYE2BA6NHP3 402 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 NFIBO00712 420 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 SPDYE6P0CI01 402 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 GHRP10912 638 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 CALCOCO2Q13137 446 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 RNF207Q6ZRF8 634 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC91Q7Z6B0 441 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 HELQQ8TDG4 1101 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM151AQ8WW52 585 aa29.02■■■□□ 2.24
SH3BP2-221ENST00000511747 CLDN3O15551 220 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 SAAL1Q96ER3 474 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 SGSM3Q96HU1 749 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC113Q9H0I3 377 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PDE6CP51160 858 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 XRCC4Q13426 336 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PARP9Q8IXQ6 854 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PARD3BQ8TEW8 1205 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC134Q9H6E4 229 aa29.01■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TP73O15350 636 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 LYPLA2O95372 231 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ICAM1P05362 532 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 DLATP10515 647 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 NCKAP1LP55160 1127 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC38Q502W7 563 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 STYK1Q6J9G0 422 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 C1orf54Q8WWF1 131 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF536O15090 1300 aa29■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PPIP5K2O43314 1243 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CAP2P40123 477 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PTGER2P43116 358 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 IFNAR2P48551 515 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 MTMR1Q13613 665 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 MFSD5Q6N075 450 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TAOK1Q7L7X3 1001 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 NIPA1Q7RTP0 329 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TAX1BP1Q86VP1 789 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 AKT1S1Q96B36 256 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 COQ4Q9Y3A0 265 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 GRIN3BO60391 1043 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 VIMP08670 466 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CNGA1P29973 690 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 GPC3P51654 580 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 UGCGQ16739 394 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF568Q3ZCX4 644 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM102BQ5T8I3 360 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 EXOC3L1Q86VI1 746 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ELMO3Q96BJ8 720 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa28.99■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 FSCN2O14926 492 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ITIH4Q14624 930 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ACAD10Q6JQN1 1059 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TAS1R2Q8TE23 839 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM8AQ9HCN3 771 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 SAMD15Q9P1V8 674 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 TBX20Q9UMR3 447 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CHRNA5P30532 468 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CNGA2Q16280 664 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 SGO2Q562F6 1265 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 SLCO2A1Q92959 643 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 PLVAPQ9BX97 442 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 AAASQ9NRG9 546 aa28.98■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX1Q13596 522 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 LONRF1Q17RB8 773 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXL13Q8NEE6 735 aa28.97■■■□□ 2.23
SH3BP2-221ENST00000511747 CLEC4DQ8WXI8 215 aa28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms