RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511398.1

LNX1-207, Transcript of ligand of numb-protein X 1, humanhuman

TSL 4

Gene LNX1, Length 622 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNX1-207ENST00000511398 TRAF7Q6Q0C0 670 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ABI1Q8IZP0 508 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 SYCP3Q8IZU3 236 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 RNF169Q8NCN4 708 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ADAM32Q8TC27 787 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TMEM40Q8WWA1 233 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 HERVK_113Q902F9 699 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ADAM2Q99965 735 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TCHPQ9BT92 498 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 NFKBIZQ9BYH8 718 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 IFT122Q9HBG6 1241 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ERVK-5Q9HDB9 667 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 CHST12Q9NRB3 414 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa8.61□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 MYMKA6NI61 221 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 N4BP3O15049 544 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 SMC2O95347 1197 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 LIG4P49917 911 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 RAB27AP51159 221 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 WDR5P61964 334 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ALCAMQ13740 583 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 LONRF3Q496Y0 759 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ARSHQ5FYA8 562 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 KRBA2Q6ZNG9 492 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 HAUS6Q7Z4H7 955 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 SFR1Q86XK3 245 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 RNF135Q8IUD6 432 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TMEM87AQ8NBN3 555 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 BSNDQ8WZ55 320 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 PGBD4Q96DM1 585 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 CPB2Q96IY4 423 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 YME1L1Q96TA2 773 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TRIM9Q9C026 710 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 CERS4Q9HA82 394 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TBC1D7Q9P0N9 293 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 EXOC7Q9UPT5 735 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 HPSEQ9Y251 543 aa8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TSPAN1O60635 241 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 KIF20AO95235 890 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 HARSP12081 509 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 COASYQ13057 564 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 MAPK7Q13164 816 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 POSTNQ15063 836 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ZNF568Q3ZCX4 644 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 CNNM4Q6P4Q7 775 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 UNC13DQ70J99 1090 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 DAW1Q8N136 415 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 LRRC15Q8TF66 581 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 CCDC51Q96ER9 411 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 PAGE5Q96GU1 130 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 C7orf25Q9BPX7 421 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 RGS18Q9NS28 235 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 RMND1Q9NWS8 449 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
LNX1-207ENST00000511398 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 ACKR2O00590 384 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 ENPP3O14638 875 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 NPTXRO95502 500 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 PTMSP20962 102 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 ZNF131P52739 623 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 YARSP54577 528 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 NCKAP1LP55160 1127 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 DEFB103AP81534 67 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 CUL4BQ13620 913 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 FAM187BQ17R55 369 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 FAM26FQ5R3K3 315 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 ATF7IP2Q5U623 682 aa8.58□□□□□ -1.04
LNX1-207ENST00000511398 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms