RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504047.1

ATXN3-208, Transcript of ataxin 3, human

TSL 3

Gene ATXN3, Length 426 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	JADE3	Q92613	823 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TFAP2C	Q92754	450 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	POGK	Q9P215	609 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	EIF2B4	Q9UI10	523 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	INTU	Q9ULD6	942 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TRIM24	O15164	1050 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ADCY6	O43306	1168 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	FZD7	O75084	574 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	C1S	P09871	688 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	RAP2A	P10114	183 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	C6	P13671	934 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TACR2	P21452	398 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	GDF5	P43026	501 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CLRN1	P58418	232 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ZXDA	P98168	799 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TUBA3C	Q13748	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	REPS2	Q8NFH8	660 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	NRG4	Q8WWG1	115 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	HOXB13	Q92826	284 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	HDAC10	Q969S8	669 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CEP95	Q96GE4	821 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CEP89	Q96ST8	783 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	NDC1	Q9BTX1	674 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	CPEB1	Q9BZB8	566 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.09	□□□□□ -1.75
ATXN3-208	ENST00000504047	PLSCR1	O15162	318 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GPR32	O75388	356 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SPATA31D3	P0C874	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ATP5J	P18859	108 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MCM7	P33993	719 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PTGS2	P35354	604 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	WAS	P42768	502 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CREM	Q03060	361 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GPRIN1	Q7Z2K8	1008 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SYNE4	Q8N205	404 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TEKT5	Q96M29	485 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TDP1	Q9NUW8	608 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TYW1	Q9NV66	732 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CEP72	Q9P209	647 aa		4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TNKS	O95271	1327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	FZD9	O00144	591 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	PCDHGA12	O60330	932 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	FAM20B	O75063	409 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	POMC	P01189	267 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MAK	P20794	623 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	C5AR1	P21730	350 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	GUCY1A2	P33402	732 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RAP2B	P61225	183 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ABHD18	Q0P651	414 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SEPT2	Q15019	361 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ANKS6	Q68DC2	871 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	RSPH3	Q86UC2	560 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	MIER2	Q8N344	545 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		4.07	□□□□□ -1.76
ATXN3-208	ENST00000504047	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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