RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-202ENST00000498438 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-202ENST00000498438 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-202ENST00000498438 CDT1Q9H211 546 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-202ENST00000498438 CXCL16Q9H2A7 254 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-202ENST00000498438 CACNG4Q9UBN1 327 aa20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-202ENST00000498438 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HOXD11-202ENST00000498438 SOD2P04179 222 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM87AQ8NBN3 555 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 RABGGTAQ92696 567 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CASP10Q92851 521 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 COLEC11Q9BWP8 271 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KCNG1Q9UIX4 513 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.2■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 EFEMP2O95967 443 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 URODP06132 367 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 THP07101 528 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 MAPTP10636 758 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 STRN3Q13033 797 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TUSC3Q13454 348 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 SYCE2Q6PIF2 218 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TAS1R1Q7RTX1 841 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB33Q86T24 672 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CEP120Q8N960 986 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 PAAF1Q9BRP4 392 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 APOL5Q9BWW9 433 aa20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CASTOR2A6NHX0 329 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 C2CD2LO14523 706 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ABLIM1O14639 778 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 FAM13AO94988 1023 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KRT18P05783 430 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 PROZP22891 400 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 NASPP49321 788 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 SLC39A14Q15043 492 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 NAB2Q15742 525 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 FUT10Q6P4F1 479 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 MPZL3Q6UWV2 235 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 S1PR5Q9H228 398 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ADAM28Q9UKQ2 775 aa20.18■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CITO14578 2027 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 LILRB3O75022 631 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 MCF2P10911 925 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 EPCAMP16422 314 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TXLNAP40222 546 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 GRM5P41594 1212 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 GLUD2P49448 558 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF131P52739 623 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 NCKAP1LP55160 1127 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 OSTNP61366 133 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 GLRA4Q5JXX5 417 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 SUSD6Q92537 303 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KLHL5Q96PQ7 755 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TCHPQ9BT92 498 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 GPR62Q9BZJ7 368 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 PARVGQ9HBI0 331 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC39Q9UFE4 941 aa20.17■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 H0YCG3 227 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TBCAO75347 108 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 HARSP12081 509 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 DDIT3P35638 169 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 STK38Q15208 465 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 MYCT1Q8N699 235 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 HASPINQ8TF76 798 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 SLC22A17Q8WUG5 538 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 B3GALT6Q96L58 329 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 PPP1R10Q96QC0 940 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 STK17AQ9UEE5 414 aa20.16■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 K7ENM7 598 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TOM1L1O75674 476 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KIF4AO95239 1232 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 BRD1O95696 1058 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KLRC2P26717 231 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 DSG1Q02413 1049 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms