RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM167A	Q96KS9	214 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBP1	Q9H171	429 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D22B	Q9NU19	505 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	INPP5F	Q9Y2H2	1132 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		12.22	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0U1RQF3	1178 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	CTSA	P10619	480 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	FGFR4	P22455	802 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GBP2	P32456	591 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LIFR	P42702	1097 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LONRF3	Q496Y0	759 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TBCEL	Q5QJ74	424 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GLB1L	Q6UWU2	654 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	NIPA1	Q7RTP0	329 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR149	Q86SP6	731 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP4K1	Q92918	833 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	GLT8D2	Q9H1C3	349 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNK12	Q9HB15	430 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	DUSP12	Q9UNI6	340 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHA10	Q9Y5I2	948 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511		R4GN57	208 aa		12.21	□□□□□ -0.45
SKAP2-209	ENST00000497511	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PNR3	127 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM86B1	E9PN63	330 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SGSM2	O43147	1006 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	THBS1	P07996	1170 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM86B2	P0C5J1	330 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NPR3	P17342	541 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MX2	P20592	715 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SET	Q01105	290 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ZC3H14	Q6PJT7	736 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RMDN1	Q96DB5	314 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF21	Q96ID5	467 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	IGSF9	Q9P2J2	1179 aa		12.2	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DMD	P11532	3685 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	EML1	O00423	815 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	GPC3	P51654	580 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RTN1	Q16799	776 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	LETM2	Q2VYF4	491 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SPECC1	Q5M775	1068 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM173	Q86WV6	379 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A17	Q8WUG5	538 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	STAM	Q92783	540 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	LPP	Q93052	612 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CA14	Q9ULX7	337 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	IRAK3	Q9Y616	596 aa		12.19	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	MYO10	Q9HD67	2058 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR64	B1ANS9	1081 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	GALT	P07902	379 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	TXLNA	P40222	546 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PUM1	Q14671	1186 aa	Known RBP eCLIP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PTPN14	Q15678	1187 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR16	Q569H4	304 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	URGCP	Q8TCY9	931 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST12	Q9NRB3	414 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	TBC1D13	Q9NVG8	400 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.18	□□□□□ -0.46
SKAP2-209	ENST00000497511	STK39	Q9UEW8	545 aa		12.18	□□□□□ -0.46

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