RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497210.5

CTPS1-211, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 463 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-211ENST00000497210 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 SH2D3AQ9BRG2 576 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 MCOLN1Q9GZU1 580 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 SUGCTQ9HAC7 445 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 KMT5AQ9NQR1 393 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 KLK14Q9P0G3 267 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 EXOC7Q9UPT5 735 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 AKT3Q9Y243 479 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa10.68□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
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CTPS1-211ENST00000497210 LRRIQ4A6NIV6 560 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CCDC169A6NNP5 214 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 RSPH10B2B2RC85 870 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 MAN1A2O60476 641 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CAND2O75155 1236 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 RSPH10BP0C881 870 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CYP2C9P11712 490 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 KLRC1P26715 233 aa10.67□□□□□ -0.7
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CTPS1-211ENST00000497210 EFNA5P52803 228 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 PEX3P56589 373 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 TPM4P67936 248 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 EHHADHQ08426 723 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 STRN3Q13033 797 aa10.67□□□□□ -0.7
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CTPS1-211ENST00000497210 MAPK7Q13164 816 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 DPCR1Q3MIW9 517 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ZNF410Q86VK4 478 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 RHPN2Q8IUC4 686 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC71Q8N4P6 559 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM143Q96AN5 459 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CEP89Q96ST8 783 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 TSG101Q99816 390 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 GPRC5CQ9NQ84 441 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 SETD4Q9NVD3 440 aa10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.67□□□□□ -0.7
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CTPS1-211ENST00000497210 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 MSX1P28360 303 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ARL2P36404 184 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 NPTX2P47972 431 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 NCKAP1LP55160 1127 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 PTGISQ16647 500 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ANO6Q4KMQ2 910 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 HS2ST1Q7LGA3 356 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 DAW1Q8N136 415 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 NME8Q8N427 588 aa10.66□□□□□ -0.7
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CTPS1-211ENST00000497210 KIAA0895Q8NCT3 520 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 GOLGA5Q8TBA6 731 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 NLRP4Q96MN2 994 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 BPIFA3Q9BQP9 254 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 NFKBIZQ9BYH8 718 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 TMEM206Q9H813 350 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 SLC39A2Q9NP94 309 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 PDLIM7Q9NR12 457 aa10.66□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 BECN2A8MW95 431 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ARVCFO00192 962 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 GLRA2P23416 452 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 LRRC63Q05C16 580 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 POU5F1BQ06416 359 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CAPSQ13938 189 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 MAPK6Q16659 721 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 BMT2Q1RMZ1 405 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 MARCH8Q5T0T0 291 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 SERINC5Q86VE9 423 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 SYCP3Q8IZU3 236 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 LINC01465Q8N7H1 131 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 RNF149Q8NC42 400 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 KCNN1Q92952 543 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 BICD1Q96G01 975 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ACCSQ96QU6 501 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 FUCA2Q9BTY2 467 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 DNAJC25Q9H1X3 360 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 TBC1D7Q9P0N9 293 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 CTNND2Q9UQB3 1225 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 GDAQ9Y2T3 454 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 DYRK1BQ9Y463 629 aa10.65□□□□□ -0.7
CTPS1-211ENST00000497210 DENND3A2RUS2 1198 aa10.64□□□□□ -0.71
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