RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496055.5

RABGGTB-213, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 3,863 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-213ENST00000496055 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SYTL1Q8IYJ3 562 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 IFNL3Q8IZI9 196 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SPARTQ8N0X7 666 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NKAIN3Q8N8D7 197 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BBOF1Q8ND07 529 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CDKL2Q92772 493 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FATE1Q969F0 183 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FAM20AQ96MK3 541 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TTC25Q96NG3 672 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CGREF1Q99674 301 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 GOLGA8IPA6NC78 632 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC166P0CW27 439 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ACADSBP45954 432 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FNTAP49354 379 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LIMK1P53667 647 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 C21orf58P58505 322 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCNG2Q16589 344 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC26Q2I0M4 334 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC14Q49A88 953 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MTERF2Q49AM1 385 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ANO1Q5XXA6 986 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NLRP9Q7RTR0 991 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SPATA18Q8TC71 538 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 FERMT2Q96AC1 680 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SELENOOQ9BVL4 669 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RHBDL2Q9NX52 303 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 HMGXB4Q9UGU5 601 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF180Q9UJW8 692 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TMX2Q9Y320 296 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF536O15090 1300 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MCF2LO15068 1137 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SMIM24O75264 130 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NUBP1P53384 320 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TLE2Q04725 743 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM32Q13049 653 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PSMD6Q15008 389 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCL14Q16627 93 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MAJINQ3KP22 176 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CCDC153Q494R4 210 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CEP78Q5JTW2 689 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ANKRD42Q8N9B4 389 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NAPBQ9H115 298 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ARMT1Q9H993 441 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SMYD2Q9NRG4 433 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 AIPL1Q9NZN9 384 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 USP17L12C9JPN9 530 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 USP17L21D6R901 530 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 PITPNM1O00562 1244 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CYTH3O43739 400 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 NBNO60934 754 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ADAMTS4O75173 837 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 RASGRP1O95267 797 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SERPINC1P01008 464 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LINGO3P0C6S8 592 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CLCN6P51797 869 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MYL6P60660 151 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 LRRC74AQ0VAA2 488 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CETN1Q12798 172 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BCL2A1Q16548 175 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TRIM60Q495X7 471 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 CPXCR1Q8N123 301 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ACER1Q8TDN7 264 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ATG4CQ96DT6 458 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TOX2Q96NM4 488 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ERP44Q9BS26 406 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 BOLA2Q9H3K6 86 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TXNRD2Q9NNW7 524 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 TMCO1Q9UM00 188 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ELP1O95163 1332 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGGTB-213ENST00000496055 ZBBXA8MT70 800 aa4.9□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms