RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492827.1

MTRF1-208, Transcript of mitochondrial translation release factor 1, human

TSL 3

Gene MTRF1, Length 618 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MTRF1-208	ENST00000492827	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	KLC2	Q9H0B6	622 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	LANCL2	Q9NS86	450 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		6.27	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CCDC154	A6NI56	674 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	DTNB	O60941	627 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ZNF623	O75123	536 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ABLIM3	O94929	683 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	GNAT2	P19087	354 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	COMT	P21964	271 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	WAS	P42768	502 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	FOXL1	Q12952	345 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827		Q6ZVL8	140 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	STON2	Q8WXE9	905 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	FAM89A	Q96GI7	184 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	TDP1	Q9NUW8	608 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	TMEM140	Q9NV12	185 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		6.26	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	IL2RB	P14784	551 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	AKAP5	P24588	427 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CYP2C19	P33261	490 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	TGFB2	P61812	414 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PTH1R	Q03431	593 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ELAVL1	Q15717	326 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PRAMEF14	Q5SWL7	426 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	REPS2	Q8NFH8	660 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CAMKK2	Q96RR4	588 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CDH19	Q9H159	772 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	LDAH	Q9H6V9	325 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	TCAF1	Q9Y4C2	921 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		6.25	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ZMYM3	Q14202	1370 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CAPN14	A8MX76	684 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PATE3	B3GLJ2	98 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ADCY6	O43306	1168 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	U2AF1L5	P0DN76	240 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PDC	P20941	246 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SREBF1	P36956	1147 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	U2AF1	Q01081	240 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	DUSP8	Q13202	625 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	IL10RA	Q13651	578 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ICAM4	Q14773	271 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SEPT2	Q15019	361 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	FAM83A	Q86UY5	434 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827		Q8TCH9	128 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	LRGUK	Q96M69	825 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		6.24	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	CYP27B1	O15528	508 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	OFD1	O75665	1012 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	RFPL1	O75677	317 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	STC2	O76061	302 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	RAP2A	P10114	183 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	FHL2	Q14192	279 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ATP2B3	Q16720	1220 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	DRC7	Q8IY82	874 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	LILRA3	Q8N6C8	439 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ST8SIA2	Q92186	375 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	MIEF2	Q96C03	454 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	ENKD1	Q9H0I2	346 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SPON1	Q9HCB6	807 aa		6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
MTRF1-208	ENST00000492827	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		6.23	□□□□□ -1.41

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