RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491899.1

TTLL4-220, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, humanhuman

TSL 4

Gene TTLL4, Length 589 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL4-220ENST00000491899 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 COLGALT2Q8IYK4 626 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 AUTS2Q8WXX7 1259 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 BSNDQ8WZ55 320 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MSLNLQ96KJ4 702 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 NECTIN4Q96NY8 510 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 TMEM134Q9H6X4 195 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 CLEC1BQ9P126 229 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 NR2E1Q9Y466 385 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 TRANK1O15050 2925 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 CASTOR2A6NHX0 329 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SFI1A8K8P3 1242 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SLC16A4O15374 487 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 DCXO43602 365 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PLS3P13797 630 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SYT1P21579 422 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ABCD1P33897 745 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MTHFRP42898 656 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 OSTNP61366 133 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 TUSC3Q13454 348 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PTPN14Q15678 1187 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 IL17AQ16552 155 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 USP41Q3LFD5 358 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ATAT1Q5SQI0 421 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 HYIQ5T013 277 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 FUT10Q6P4F1 479 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 C1orf186Q6ZWK4 172 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 GPBP1Q86WP2 473 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 CEP57Q86XR8 500 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MYCT1Q8N699 235 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ACAP3Q96P50 834 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 RUSC1Q9BVN2 902 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SFXN1Q9H9B4 322 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SLC38A7Q9NVC3 462 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ADAM28Q9UKQ2 775 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ODF2LQ9ULJ1 636 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 TNFSF13BQ9Y275 285 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 IRAK3Q9Y616 596 aa9.54□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 K7ENM7 598 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 INPPL1O15357 1258 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 TRAPPC3O43617 180 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 STX6O43752 255 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 GLUD1P00367 558 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 SP100P23497 879 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 LIG4P49917 911 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 RBM10P98175 930 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 KARSQ15046 597 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 STK38Q15208 465 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PDXDC1Q6P996 788 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MPZL3Q6UWV2 235 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 KCNK18Q7Z418 384 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 HASPINQ8TF76 798 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 FBXL18Q96ME1 805 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 UROC1Q96N76 676 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 KLHL5Q96PQ7 755 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PNMA5Q96PV4 448 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 CCDC113Q9H0I3 377 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 EPHX3Q9H6B9 360 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PIDD1Q9HB75 910 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PARVGQ9HBI0 331 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MARCH5Q9NX47 278 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 MIOSQ9NXC5 875 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 USP20Q9Y2K6 914 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL4-220ENST00000491899 PI4K2BG5E9Z4 385 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 CLDN3O15551 220 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 XPOTO43592 962 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 B3GAT3O94766 335 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 CNPP09543 421 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 MCF2P10911 925 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 PLCG1P19174 1290 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 COL9A1P20849 921 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 SCP2P22307 547 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 GRM5P41594 1212 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 SLC12A3P55017 1021 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 DSC1Q08554 894 aa9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP9.52□□□□□ -0.89
TTLL4-220ENST00000491899 TMEM119Q4V9L6 283 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms