RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 HOXA9P31269 272 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CCR3P51677 355 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SLC5A5Q92911 643 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CLSTN3Q9BQT9 956 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 C6orf50Q9HD87 102 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.47■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ESYT2A0FGR8 921 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 MAN2B1O00754 1011 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SLC27A2O14975 620 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TADA2AO75478 443 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 FNTBP49356 437 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SATB1Q01826 763 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 PLA2G4FQ68DD2 849 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TANGO2Q6ICL3 276 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ANO5Q75V66 913 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 RDM1Q8NG50 284 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SLC7A14Q8TBB6 771 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 TMEM143Q96AN5 459 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 MCRS1Q96EZ8 462 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 IER2Q9BTL4 223 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 LMAN1LQ9HAT1 526 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 CACNG4Q9UBN1 327 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 BRPF3Q9ULD4 1205 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
ATG4B-222ENST00000491867 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TM4SF5O14894 197 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ADAM12O43184 909 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ZBTB43O43298 467 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 EDIL3O43854 480 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 PSMD10O75832 226 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CXCL12P48061 93 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 LIMK1P53667 647 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 DNASE1L2Q92874 299 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TTPALQ9BTX7 342 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GDE1Q9NZC3 331 aa15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GOLGA8AA7E2F4 631 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GOLGA8BA8MQT2 603 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ERLIN2O94905 339 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 POU2F2P09086 479 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 C1QTNF9P0C862 333 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CDC27P30260 824 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 NPEPPSP55786 919 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GRM2Q14416 872 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 PSMD5Q16401 504 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 POTEHQ6S545 545 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CEP57Q86XR8 500 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 HASPINQ8TF76 798 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 SLC7A3Q8WY07 619 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 PIK3R5Q8WYR1 880 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 FAM3CQ92520 227 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CPB2Q96IY4 423 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 PAAF1Q9BRP4 392 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 BRD9Q9H8M2 597 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GIT1Q9Y2X7 761 aa15.44■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 TSPAN1O60635 241 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 AKAP5P24588 427 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CNR2P34972 360 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 GAS6Q14393 721 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 NECTIN1Q15223 517 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC6Q16204 474 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 SLC5A9Q2M3M2 681 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 FAM171A1Q5VUB5 890 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 NOTUMQ6P988 496 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CEP68Q76N32 757 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 RNF149Q8NC42 400 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ELSPBP1Q96BH3 223 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC51Q96ER9 411 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 CSRNP2Q9H175 543 aa15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
ATG4B-222ENST00000491867 ANO2Q9NQ90 1003 aa15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms