RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 USTQ9Y2C2 406 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 HTTP42858 3142 aa8.5□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KBTBD13C9JR72 458 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CTAGE5O15320 804 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 USO1O60763 962 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 TBCAO75347 108 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ABL1P00519 1130 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 AFMP43652 599 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 RARRES1P49788 294 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CHMP4BP1P59074 171 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ASIC1P78348 528 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 NKX3-2P78367 333 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ATP11AP98196 1134 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 AMPD3Q01432 767 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PPFIA1Q13136 1202 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 POSTNQ15063 836 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PLCB4Q15147 1175 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 MTERF2Q49AM1 385 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 XKR9Q5GH70 373 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CEP170P1Q96L14 293 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 DEFB118Q96PH6 123 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 RNF208Q9H0X6 261 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 NRBP2Q9NSY0 501 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PPME1Q9Y570 386 aa8.49□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 COL1A2P08123 1366 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 LOC100996750A0A140TA64 210 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM150BA6NC51 233 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 H3BRB1 525 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 HBP1O60381 514 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CABYRO75952 493 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 FAM13AO94988 1023 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KIF4AO95239 1232 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SMC2O95347 1197 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 MYL1P05976 194 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SLC12A3P55017 1021 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PSMC6P62333 389 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PNOCQ13519 176 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 EMC2Q15006 297 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 LRRC41Q15345 812 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CAMK4Q16566 473 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CEP135Q66GS9 1140 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ANO5Q75V66 913 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 PAGE5Q96GU1 130 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 C16orf70Q9BSU1 422 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 TRIM9Q9C026 710 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 BLZF1Q9H2G9 400 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KBTBD4Q9NVX7 518 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KCND2Q9NZV8 630 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.48□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 A0A087WWV3 80 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 A6NHS1 94 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 MYMKA6NI61 221 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 DNM1LO00429 736 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 STBD1O95210 358 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ASGR1P07306 291 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 IDEP14735 1019 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 CYP11B2P19099 503 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ACLYP53396 1101 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 NPEPPSP55786 919 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 IGBP1P78318 339 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KCNA10Q16322 511 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF484Q5JVG2 852 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 XKR5Q6UX68 686 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 MCPH1Q8NEM0 835 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 STAMQ92783 540 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 KAT2BQ92831 832 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 SMARCE1Q969G3 411 aa8.47□□□□□ -1.05
GARNL3-218ENST00000487565 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms