RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 ASGR2P07307 311 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 AVPR2P30518 371 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 MRE11P49959 708 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PTGDRQ13258 359 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 IER5LQ5T953 404 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 BSNDQ8WZ55 320 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 RABGGTAQ92696 567 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 CHST7Q9NS84 486 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 DNM3Q9UQ16 869 aa22.22■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 F8W810 466 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 MYBP10242 640 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.153e-17■□□□□ 9.4
ACTB-212ENST00000484841 NBR1Q14596 966 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 MCTP1Q6DN14 999 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 GLYCTKQ8IVS8 523 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 GPR65Q8IYL9 337 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 HDAC7Q8WUI4 952 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 B3GALT6Q96L58 329 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 FNIP2Q9P278 1114 aa22.21■■□□□ 1.15
ACTB-212ENST00000484841 CASTOR2A6NHX0 329 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 CCDC169A6NNP5 214 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 K7ERI5 159 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RECQL4O94761 1208 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 EFEMP2O95967 443 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 C1RP00736 705 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31D3P0C874 917 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RABEP1Q15276 862 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 DTHD1Q6ZMT9 781 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 CEP57Q86XR8 500 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PRSS33Q8NF86 280 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 CCDC113Q9H0I3 377 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 GDAQ9Y2T3 454 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 ZNF318Q5VUA4 2279 aa22.2■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 ATF7IP2Q5U623 682 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 HASPINQ8TF76 798 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 KIF2CQ99661 725 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.19■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TTLL13PA6NNM8 815 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TGM5O43548 720 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 NUBP1P53384 320 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TDGQ13569 410 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 ECM1Q16610 540 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 C8orf34Q49A92 452 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PDXDC1Q6P996 788 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 DRC1Q96MC2 740 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TTPALQ9BTX7 342 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 POLD4Q9HCU8 107 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 IGSF9Q9P2J2 1179 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.18■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 H3BQV1 296 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PRPHP41219 470 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PEX3P56589 373 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PAAF1Q9BRP4 392 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 FBXL21Q9UKT6 434 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 USP20Q9Y2K6 914 aa22.17■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 CLUHO75153 1309 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 E9PMD0 336 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PTGESO14684 152 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RFPL2O75678 378 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 KIF4AO95239 1232 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RPL17P18621 184 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 LIN9Q5TKA1 542 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 EEF1DP3Q658K8 133 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 FEZF2Q8TBJ5 459 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 NT5C3AQ9H0P0 336 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 KCNK12Q9HB15 430 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 KMT5AQ9NQR1 393 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 KCNG1Q9UIX4 513 aa22.16■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 PSMD5Q16401 504 aa22.15■■□□□ 1.14
ACTB-212ENST00000484841 RTP2Q5QGT7 225 aa22.15■■□□□ 1.14
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