RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 ATP8B4Q8TF62 1192 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MYLK2Q9H1R3 596 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PRR12Q9ULL5 1215 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa17.33■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NHSQ6T4R5 1651 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NVLO15381 856 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MAPK7Q13164 816 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SEL1L2Q5TEA6 688 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 STMN2Q93045 179 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GIT2Q14161 759 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CPXCR1Q8N123 301 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC57Q8N9N7 239 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 STK32AQ8WU08 396 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MCUR1Q96AQ8 359 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PWWP2AQ96N64 755 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KCNMB3Q9NPA1 279 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF3Q9NR81 526 aa17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CYP2J2P51589 502 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 VPS52Q8N1B4 723 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SPOCK2Q92563 424 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PLIN4Q96Q06 1357 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RIPK2O43353 540 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 AFPP02771 609 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KRT15P19012 456 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SLC12A3P55017 1021 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 STRIP1Q5VSL9 837 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CCNJLQ8IV13 435 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SLFN12Q8IYM2 578 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 DCAF4Q8WV16 495 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 C1orf54Q8WWF1 131 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NYAP2Q9P242 653 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 BAG2O95816 211 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GJC1P36383 396 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PTENP60484 403 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 COG2Q14746 738 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 DUPD1Q68J44 220 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ECHDC2Q86YB7 292 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 AIPL1Q9NZN9 384 aa17.31■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CCDC160A6NGH7 325 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 A6NHS1 94 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 FAM13AO94988 1023 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 UNC5CO95185 931 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MARCKSL1P49006 195 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RASSF2P50749 326 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ZCWPW2Q504Y3 356 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 FAM13CQ8NE31 585 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 C9orf72Q96LT7 481 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CYTH2Q99418 400 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 FAM118BQ9BPY3 351 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 AKAP3O75969 853 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ETS2P15036 469 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SP100P23497 879 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 DGKZQ13574 1117 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RCN1Q15293 331 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 MTUS1Q9ULD2 1270 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RASA4BC9J798 803 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RASA4O43374 803 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SKIP12755 728 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM59Q8IWR1 403 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 UBL4BQ8N7F7 174 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ETNPPLQ8TBG4 499 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ALG3Q92685 438 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 TMOD2Q9NZR1 351 aa17.3■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ATP9AO75110 1047 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 GNA14O95837 355 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 C10orf76Q5T2E6 689 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KRT35Q92764 455 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KCTD10Q9H3F6 313 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 RPTORQ8N122 1335 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 NUDT17P0C025 328 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 SCNN1BP51168 640 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 STAT2P52630 851 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa17.29■□□□□ 0.36
CCSAP-204ENST00000483092 CROCCP2Q86T23 111 aa17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms