RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477812.1

ACTB-210, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 2

Gene ACTB, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-210ENST00000477812 CLTAP09496 248 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ITGA4P13612 1032 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 AKAP5P24588 427 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GATMP50440 423 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 PAK1Q13153 545 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 MYBPC2Q14324 1141 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 STX1AQ16623 288 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 KLHL10Q6JEL2 608 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 RNF169Q8NCN4 708 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 PGBD4Q96DM1 585 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 APOL6Q9BWW8 343 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 PCIF1Q9H4Z3 704 aa21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CALUO43852 315 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 EXTL3O43909 919 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 UPP2O95045 317 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ADRB2P07550 413 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ACOT2P49753 483 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CYP2J2P51589 502 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 OSTNP61366 133 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 KYAT1Q16773 422 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 XKR4Q5GH76 650 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 HACE1Q8IYU2 909 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CXCL16Q9H2A7 254 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 RSAD1Q9HA92 442 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ANO10Q9NW15 660 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GIT1Q9Y2X7 761 aa21.74■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 OFD1O75665 1012 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CXCL8P10145 99 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SLC10A6Q3KNW5 377 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ALKAL1Q6UXT8 129 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GPD1LQ8N335 351 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SNX27Q96L92 541 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ZFP42Q96MM3 310 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ACAP3Q96P50 834 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CASD1Q96PB1 797 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 UBN1Q9NPG3 1134 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 RWDD2AQ9UIY3 292 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 LRFN2Q9ULH4 789 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 TTC26A0AVF1 554 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ARL5CA6NH57 179 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 HOXA2O43364 376 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 NR2F2P24468 414 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 MLH1P40692 756 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 HELQQ8TDG4 1101 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GAD1Q99259 594 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 TSG101Q99816 390 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 TMEM117Q9H0C3 514 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 DACH1Q9UI36 760 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 A0A1W2PPC1 479 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 BICDL2A1A5D9 508 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 PTGESO14684 152 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 LDHAP00338 332 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CASP4P49662 377 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 WNT7BP56706 349 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 STX17P56962 302 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 FAM117BQ6P1L5 589 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 GLB1LQ6UWU2 654 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 RSPH1Q8WYR4 309 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 KIAA1586Q9HCI6 787 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 KLK14Q9P0G3 267 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CNTN3Q9P232 1028 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 PARP2Q9UGN5 583 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 ANK1P16157 1881 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-210ENST00000477812 CITO14578 2027 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-210ENST00000477812 GRXCR1A8MXD5 290 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-210ENST00000477812 AKAP3O75969 853 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-210ENST00000477812 CCDC192P0DO97 292 aa21.7■■□□□ 1.06
ACTB-210ENST00000477812 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-210ENST00000477812 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-210ENST00000477812 DNAJC25Q9H1X3 360 aa21.7■■□□□ 1.06
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