RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469241.2

PKD1-205, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, humanhuman

TSL 2

Gene PKD1, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1-205ENST00000469241 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.81■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 STK24Q9Y6E0 443 aa22.81■■□□□ 1.24
PKD1-205ENST00000469241 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 NBR1Q14596 966 aa22.8■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.8■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 KIAA1024Q9UPX6 916 aa22.8■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.79■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 KIFC3Q9BVG8 833 aa22.78■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 TGM5O43548 720 aa22.77■■□□□ 1.24
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PKD1-205ENST00000469241 E9PMD0 336 aa22.73■■□□□ 1.23
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PKD1-205ENST00000469241 ST18O60284 1047 aa22.73■■□□□ 1.23
PKD1-205ENST00000469241 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
PKD1-205ENST00000469241 PEX3P56589 373 aa22.73■■□□□ 1.23
PKD1-205ENST00000469241 NT5DC1Q5TFE4 455 aa22.73■■□□□ 1.23
PKD1-205ENST00000469241 LIN9Q5TKA1 542 aa22.73■■□□□ 1.23
PKD1-205ENST00000469241 PDXDC1Q6P996 788 aa22.73■■□□□ 1.23
PKD1-205ENST00000469241 LILRA6Q6PI73 481 aa22.73■■□□□ 1.23
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