RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 DDR1Q08345 913 aa2.28□□□□□ -2.04
SHQ1-204ENST00000468347 PAK1Q13153 545 aa2.28□□□□□ -2.04
SHQ1-204ENST00000468347 NOSTRINQ8IVI9 506 aa2.28□□□□□ -2.04
SHQ1-204ENST00000468347 SHDQ96IW2 340 aa2.28□□□□□ -2.04
SHQ1-204ENST00000468347 GJB4Q9NTQ9 266 aa2.28□□□□□ -2.04
SHQ1-204ENST00000468347 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
SHQ1-204ENST00000468347 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 GRID2O43424 1007 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ALDH1A2O94788 518 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TUBB4AP04350 444 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 T-ENOLP0DO92 83 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF585BQ52M93 769 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 CATSPEREQ5SY80 951 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 KAZNQ674X7 775 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 C16orf59Q7L2K0 433 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 RHOT2Q8IXI1 618 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 RNF169Q8NCN4 708 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 OSBPL6Q9BZF3 934 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 KLHL11Q9NVR0 708 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 PADI4Q9UM07 663 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa2.27□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 A0A087WYN8 130 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 PRLP01236 227 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 CRY1Q16526 586 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ANKS6Q68DC2 871 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 FAM43AQ8N2R8 423 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 NANOGP1Q8N7R0 232 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 FAM169BQ8N8A8 192 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 NACC2Q96BF6 587 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa2.26□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ASXL2Q76L83 1435 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 MPPED1O15442 326 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 GAAP10253 952 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 HOXC13P31276 330 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 SLC6A3Q01959 620 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ROM1Q03395 351 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 FSTL4Q6MZW2 842 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 SYNPOQ8N3V7 929 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 SSH3Q8TE77 659 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TFAP2CQ92754 450 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 CAMKK2Q96RR4 588 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 C1orf115Q9H7X2 142 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 SERGEFQ9UGK8 458 aa2.25□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TBKBP1A7MCY6 615 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 B5MCH6 92 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 LINC01565O15544 149 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 FSBPO95073 299 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 CHN2P52757 468 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 RAB33AQ14088 237 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 MAN2A1Q16706 1144 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 PCDH19Q8TAB3 1148 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 DLG3Q92796 817 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ZSWIM1Q9BR11 485 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa2.24□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 BLACEA4D250 179 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 DRGXA6NNA5 263 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 YY2O15391 372 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 VAV2P52735 878 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM132BQ14DG7 1078 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 PROSER3Q2NL68 480 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 Q4G0T1 1027 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 RASAL3Q86YV0 1011 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 PIK3C3Q8NEB9 887 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 LMLNQ96KR4 655 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 HAPLN3Q96S86 360 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa2.23□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1B0GTW7 788 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PQU0 124 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 FGBP02675 491 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGAP25P42331 645 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 DUSP2Q05923 314 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 CYP2A13Q16696 494 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 NBPF8Q3BBV2 869 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 FAM153CQ494X1 144 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TSHZ3Q63HK5 1081 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 SLFN12LQ6IEE8 588 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 PIGOQ8TEQ8 1089 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TFAP2BQ92481 460 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 E2F7Q96AV8 911 aa2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
SHQ1-204ENST00000468347 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-204ENST00000468347 LINC00473A8K010 186 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-204ENST00000468347 GSTA4O15217 222 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-204ENST00000468347 CLEC2LP0C7M8 214 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM191BP0C7N4 346 aa2.21□□□□□ -2.06
SHQ1-204ENST00000468347 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.7 ms