RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CASP1P29466 404 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 NRIP1P48552 1158 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF131P52739 623 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 EMP3P54852 163 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 NCKAP1LP55160 1127 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 DSC1Q08554 894 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ADAM15Q13444 863 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNC3Q14003 757 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP2R5AQ15172 486 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 STK38Q15208 465 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ATF7IP2Q5U623 682 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 DYMQ7RTS9 669 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 SPIRE2Q8WWL2 714 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-CQ95604 372 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC51Q96ER9 411 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 PRIMPOLQ96LW4 560 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 DRC1Q96MC2 740 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CDT1Q9H211 546 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CD320Q9NPF0 282 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 TLR9Q9NR96 1032 aa7.71□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 AAASQ9NRG9 546 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 CDH22Q9UJ99 828 aa7.71□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 CXCL14O95715 111 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 IL9P15248 144 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 KCNA1Q09470 495 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 TIGD5Q53EQ6 642 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 GLRA4Q5JXX5 417 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 HAUS6Q7Z4H7 955 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS52Q8N1B4 723 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 MYCT1Q8N699 235 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX12PQ92771 950 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP7.7□□□□□ -1.185e-6■■■□□ 19.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 TIPINQ9BVW5 301 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 STRA6Q9BX79 667 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 ZBP1Q9H171 429 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 CLDND1Q9NY35 253 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 TBC1D7Q9P0N9 293 aa7.7□□□□□ -1.18
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RABGEF1-206ENST00000461017 FAN1Q9Y2M0 1017 aa7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIOO75962 3097 aa7.7□□□□□ -1.18
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