RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa21.98■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 GMNCA6NCL1 334 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 PODXLO00592 558 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 GGPS1O95749 300 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 KRT5P13647 590 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 DENND2CQ68D51 928 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 SLC39A4Q6P5W5 647 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 HOOK3Q86VS8 718 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 SAMD3Q8N6K7 520 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 KIFAP3Q92845 792 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 WNK4Q96J92 1243 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 EPB41L4BQ9H329 900 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 RIPK3Q9Y572 518 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-208ENST00000460766 CAND2O75155 1236 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 EGFRP00533 1210 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-208ENST00000460766 LLGL1Q15334 1064 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-208ENST00000460766 OTUD6AQ7L8S5 288 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 TATDN2Q93075 761 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 HVCN1Q96D96 273 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 TEPSINQ96N21 525 aa21.97■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.97■■□□□ 1.11
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IMP4-208ENST00000460766 CPP00450 1065 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 CYP24A1Q07973 514 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 USP37Q86T82 979 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 ATG4CQ96DT6 458 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 CYFIP2Q96F07 1278 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 BICD1Q96G01 975 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 RNF146Q9NTX7 359 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 UVRAGQ9P2Y5 699 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 TRAPPC3O43617 180 aa21.96■■□□□ 1.11
IMP4-208ENST00000460766 CALCAP01258 141 aa21.96■■□□□ 1.11
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IMP4-208ENST00000460766 TMC2Q8TDI7 906 aa21.96■■□□□ 1.11
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IMP4-208ENST00000460766 TLDC2A0PJX2 215 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SMIM23A6NLE4 172 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ZNF862O60290 1169 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 NUDT17P0C025 328 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CCND2P30279 289 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CIAPIN1Q6FI81 312 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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IMP4-208ENST00000460766 PAGR1Q9BTK6 254 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 NR3C2P08235 984 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 RARAP10276 462 aa21.95■■□□□ 1.1
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IMP4-208ENST00000460766 TNFAIP1Q13829 316 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SLC29A2Q14542 456 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ACAD10Q6JQN1 1059 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 FBXL18Q96ME1 805 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PARP2Q9UGN5 583 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 PNMA2Q9UL42 364 aa21.95■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SWSAP1Q6NVH7 229 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GPD1LQ8N335 351 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 RDM1Q8NG50 284 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ATP6V0A1Q93050 837 aa21.94■■□□□ 1.1
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IMP4-208ENST00000460766 SORBS3O60504 671 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GBP1P32455 592 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
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IMP4-208ENST00000460766 SEMA4AQ9H3S1 761 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 C17orf75Q9HAS0 396 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 TELO2Q9Y4R8 837 aa21.94■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GTF2H1P32780 548 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CDR1P51861 262 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 IFT88Q13099 833 aa21.93■■□□□ 1.1
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IMP4-208ENST00000460766 MDM1Q8TC05 714 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 ANAPC7Q9UJX3 599 aa21.93■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CLDN3O15551 220 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GRIN3BO60391 1043 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 FGFR4P22455 802 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 GPRASP2Q96D09 838 aa21.92■■□□□ 1.1
IMP4-208ENST00000460766 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.92■■□□□ 1.1
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