RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456953.5

SNHG17-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 17, human

TSL 3 BASIC

Gene SNHG17, Length 546 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG17-208	ENST00000456953	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	ASAP2	O43150	1006 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TSPAN1	O60635	241 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	C8A	P07357	584 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	POU2F2	P09086	479 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	CYP3A7	P24462	503 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	ADCY1	Q08828	1119 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	SPEM2	Q0P670	501 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	MTAP	Q13126	283 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	RNF149	Q8NC42	400 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	CEP170P1	Q96L14	293 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	CSRNP2	Q9H175	543 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	F5	P12259	2224 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	CCL16	O15467	120 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	14.66	□□□□□ -0.06	1e-323	■■■■□ 23.1
SNHG17-208	ENST00000456953	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TADA2A	O75478	443 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	ECI2	O75521	394 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	RET	P07949	1114 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TDGF1	P13385	188 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	GRIK3	Q13003	919 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	FZD5	Q13467	585 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	PPP2R5D	Q14738	602 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	RTP2	Q5QGT7	225 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	FERMT3	Q86UX7	667 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TBCK	Q8TEA7	893 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TCP11	Q8WWU5	503 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	IER2	Q9BTL4	223 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	APOL6	Q9BWW8	343 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	POLI	Q9UNA4	740 aa		14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	14.66	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	NID2	Q14112	1375 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	TDP2	O95551	362 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	FGD1	P98174	961 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	DDX1	Q92499	740 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	NXF3	Q9H4D5	531 aa	Known RBP	14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	GDE1	Q9NZC3	331 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	SPEG	Q15772	3267 aa		14.65	□□□□□ -0.06
SNHG17-208	ENST00000456953	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	REC8	O95072	547 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	PTEN	P60484	403 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	KRT32	Q14532	448 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	EMC2	Q15006	297 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	PSMD5	Q16401	504 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	LPAL2	Q16609	132 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	UVSSA	Q2YD98	709 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	PDXDC1	Q6P996	788 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	RTL10	Q7L3V2	364 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	ZNF687	Q8N1G0	1237 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	RABGGTA	Q92696	567 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	DNASE1L2	Q92874	299 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	CPB2	Q96IY4	423 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	CHRD	Q9H2X0	955 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		14.64	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	SHISA7	A6NL88	538 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	EML1	O00423	815 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	MAN2B1	O00754	1011 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	P4HB	P07237	508 aa	Known RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	AKAP5	P24588	427 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	DMWD	Q09019	674 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	PPP2R5C	Q13362	524 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	CSRP2	Q16527	193 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	14.63	□□□□□ -0.07
SNHG17-208	ENST00000456953	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		14.63	□□□□□ -0.07

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