RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452545.1

ABCB6-206, Transcript of ATP binding cassette subfamily B member 6 (Langereis blood group), human

TSL 4

Gene ABCB6, Length 544 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCB6-206	ENST00000452545	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ABCB6-206	ENST00000452545	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
ABCB6-206	ENST00000452545	CA14	Q9ULX7	337 aa		18.27	■□□□□ 0.52
ABCB6-206	ENST00000452545	KRBA1	A5PL33	1030 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ANAPC15	P60006	121 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TUSC3	Q13454	348 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	LILRA6	Q6PI73	481 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	MCPH1	Q8NEM0	835 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	GTF3C6	Q969F1	213 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		18.26	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	POTEM	A6NI47	508 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ZMYND10	O75800	440 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PAPLN	O95428	1278 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	LAMP2	P13473	410 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ATP2B1	P20020	1258 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	LIN9	Q5TKA1	542 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PPP4R3CP	Q6ZMV5	832 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CEP57	Q86XR8	500 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ADSSL1	Q8N142	457 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	HASPIN	Q8TF76	798 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	MTMR9	Q96QG7	549 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	WNT7A	O00755	349 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	N4BP3	O15049	544 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	FSHR	P23945	695 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ME3	Q16798	604 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	RTP2	Q5QGT7	225 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	GPR152	Q8TDT2	470 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TUFT1	Q9NNX1	390 aa		18.24	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	LARGE1	O95461	756 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TH	P07101	528 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	SPATA31C1	P0DKV0	1188 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	LIG1	P18858	919 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	MCM7	P33993	719 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	FOXK2	Q01167	660 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	HTR4	Q13639	388 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PSMD5	Q16401	504 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	FAM187B	Q17R55	369 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CATSPER3	Q86XQ3	398 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	NACC1	Q96RE7	527 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	FZD8	Q9H461	694 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ARHGEF3	Q9NR81	526 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	SNTG2	Q9NY99	539 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		18.23	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ANHX	E9PGG2	379 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	JAK2	O60674	1132 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	RECQL4	O94761	1208 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	KIF4A	O95239	1232 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PRKCB	P05771	671 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	MAPK6	Q16659	721 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	SPECC1	Q5M775	1068 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PDXDC1	Q6P996	788 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	GRASP	Q7Z6J2	395 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	ERMN	Q8TAM6	284 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		18.22	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PTGES	O14684	152 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	XYLB	O75191	536 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	MED24	O75448	989 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	C8A	P07357	584 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	PADI6	Q6TGC4	694 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	CDH7	Q9ULB5	785 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	POLI	Q9UNA4	740 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		18.21	■□□□□ 0.51
ABCB6-206	ENST00000452545	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ABCB6-206	ENST00000452545	ACKR2	O00590	384 aa		18.2	■□□□□ 0.5
ABCB6-206	ENST00000452545	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	18.2	■□□□□ 0.5
ABCB6-206	ENST00000452545	NTHL1	P78549	312 aa		18.2	■□□□□ 0.5

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms