RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448190.6

SNHG4-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, humanhuman

TSL 4

Gene SNHG4, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG4-201ENST00000448190 RWDD3Q9Y3V2 267 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ARID2Q68CP9 1835 aa14.63□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 TRANK1O15050 2925 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 F8W810 466 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PPP1R37O75864 691 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 TNFSF9P41273 254 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 GRM5P41594 1212 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 OR1G1P47890 313 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 CAMK1Q14012 370 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.071e-323■■■■■ 39.1
SNHG4-201ENST00000448190 GLRA4Q5JXX5 417 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 UNC13DQ70J99 1090 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 MAP4K3Q8IVH8 894 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SYCP3Q8IZU3 236 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 TMEM130Q8N3G9 435 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 POF1BQ8WVV4 589 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ACAP3Q96P50 834 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 RPS6KC1Q96S38 1066 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 MSTO1Q9BUK6 570 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 MAGEF1Q9HAY2 307 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 USP25Q9UHP3 1055 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PTPRSQ13332 1948 aa14.62□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 COL4A6Q14031 1691 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PTGESO14684 152 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 NRP1O14786 923 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 KLRC4O43908 158 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 IRS1P35568 1242 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ERVFC1P60507 584 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SPAG1Q07617 926 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 MCL1Q07820 350 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 KMT5BQ4FZB7 885 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 FAM212AQ96EL1 285 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 OLFML3Q9NRN5 406 aa14.61□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 A0A0B4J269 797 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 CASTOR2A6NHX0 329 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 NR1I2O75469 434 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PIGRP01833 764 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ADSSP30520 456 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 HOXD13P35453 343 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ACOT2P49753 483 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 KRT17Q04695 432 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PTPROQ16827 1216 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SLC10A6Q3KNW5 377 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SLC39A11Q8N1S5 342 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 P2RX5Q93086 422 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PCIF1Q9H4Z3 704 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 IGFLR1Q9H665 355 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PRDM6Q9NQX0 595 aa14.6□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 REV3LO60673 3130 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 GOLGA8IPA6NC78 632 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 INPPL1O15357 1258 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SLC34A2O95436 690 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 THP07101 528 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 CXCL8P10145 99 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 SCP2P22307 547 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 FAM160A1Q05DH4 1040 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 STK4Q13043 487 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 PNOCQ13519 176 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 ALKAL1Q6UXT8 129 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 AUTS2Q8WXX7 1259 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 POMGNT1Q8WZA1 660 aa14.59□□□□□ -0.07
SNHG4-201ENST00000448190 KCNN1Q92952 543 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms